“萨德”系统和陆基“宙斯盾”系统是分别针对美国的陆军和海军研制的，两大军种的作战需求不同，导致这两种导弹防御系统虽然任务相近，但性能差异依然十分明显。因此，日本在引进过程中反复犹豫不决。

“萨德”系统

“萨德”系统的主要优势在于能够实现灵活的机部署。为美国陆军量身打造的“萨德”系统采用了模块化的车载发射系统设计，可以通过公路机动的方式变换发射阵地，具有很强的战场生存能力。“萨德”系统的动能拦截弹发射车是以美国陆军现役的M1075卡车为基础设计的，每辆发射车可以携带8枚动能拦截弹，全重为40吨，可以使用C-5或C-17运输机空运。

“宙斯盾”系统

而陆基“宙斯盾”系统为快速实现低成本改造任务，所以并没有进行地面机动化的适应性改造，这就使其只能以固定部署为基本方案，无法实现机动部署。

“萨德”系统中最引人瞩目的部分就是AN／TPY-2型X波段AESA雷达。该雷达是目前世界上最大，功能最强的陆基机动雷达，最大探测距离超过2000千米，在外界传感器的支持下，可以在800千米外发现雷达截面为0．01平方米的导弹弹头。而陆基“宙斯盾”系统所装备的AN／／SPY-1D型雷达由于采用S波段，因此在精度方面落后于AN／TPY-2型雷达，且AN／／SPY-1D型雷达的探测距离只有600千米，也与N／TPY-2型雷达存在很大差距。

尽管“萨德”系统的反导拦截效果远比“爱国者”PAC-3强，但与陆基“宙斯盾”系统相比，“萨德”系统也存在十分明显的劣势。“萨德”系统所装备的携带KKV(动能杀伤器)的拦截弹最大射高只有150千米，最大速度只有约2．8千米／秒，这两项指标均远远落后于陆基“宙斯盾”系统所装备的“标准”-3 BlockI／n型拦截弹。且“萨德”系统所装备的导弹类型相当单一，由于KKV脉冲发动机的横向修正范围有限，又没有安装气动控制面，在大气层内拦截目标的效能随着高度降低而降低，高度低于30千米的飞行目标就会进入“萨德”系统的攻击盲区。

“爱国者”PAC-3

而陆基“宙斯盾”系统不但具备对中程甚至中远程弹道导弹的拦截能力，还能兼容“标准”-2系列和“改进型海麻雀”等防空导弹，在作战方式和武器配置等方面远比“萨德”系统要灵活得多。

“萨德”系统的另外一大劣势，就是其过于高昂的价格。除近期麻烦不断的韩国外，此前只有中东地区的阿联酋和沙特阿拉伯这样“土豪”级别的国家引进过“萨德”系统。一套完整的“萨德”系统的价格超过15亿美元。而陆基“宙斯盾”系统的价格则要实惠得多，只有6亿至7亿美元左右。2017年1月，日本防卫大臣稻田朋美专程前往关岛，考察了美军部署在当地的“萨德”系统。这使得外界普遍认为日本引进“萨德”系统已成水到渠成之势。但到了2017年明，日本防卫省出于性价比的考量，最终还是选择了陆基“宙斯盾”系统。因为日本防卫省认为必须

引进6套“萨德”系统才能保护日本全境，而部署2-3套陆基宙斯盾系统就可完成相似的任务，且拦截范围更大。