治疗一般感染尽量不用抗生素，应用中草药治疗和预防疾病具有安全，无明显毒害残留，副作用小，从全局考虑，为避免药物残留和细菌药性，一般感染尽量不用抗生素。

应用抗生素药物后的不良反应有毒性反应；过敏反应；二重感染，应要引起重视。

毒性反应：主要表现在神经系统、消化系统、肝脏、肾脏、血液循环系统和局部，毒性反应的产生要药物对各种组织器官的直接损害或化学性刺激所致，在某些情况下则可由蛋白质合成或酶系统受到抑制引成。

神经系统、中枢神经比较敏感: 任何抗生素药物注入鞘内或脑室内，均可引起一定反应，严重者甚至发生抽搐、昏迷、呼吸、循环衰竭等，避免鞘内和脑室内注射。

消化系统猪是单胃动物，内服大剂量广谱抗生素可降低胃肠蠕动和消化腺的分泌，还可引起呕吐便秘，腹泻。

抗生素是杀菌的，动物生长发育需要体内大量的益生菌综合作用抗生素只能杀死这些体内不同种类的肠道菌群，不但不利于畜禽生长发育，而且会导致畜禽体内有害菌的耐药性增强，这样禽畜万一发生疾病，一般剂量的抗生素就没有作用了，也会造成养殖场长期使用抗生素才能够维持养殖相对安全，导致养殖成本大大提升。