Nintendo Switch Online 的云端存档备份功能并不是每一款游戏都会支持，其中像是《精灵宝可梦 Let’s Go！皮卡丘 / Let’s Go！伊布》、《Splatoon 2》等作品都不在支援行列当中。而任天堂现在出面解释这是为了防止玩家利用存档备份的功能来进行游戏作弊，但也有玩家不认同他们这样的作法。

外媒在报导相关消息后收到了任天堂的回应，任天堂表示特定游戏不支持是担心有作弊之嫌：

绝大多数的 Nintendo Switch 游戏都会支持云端存档备份功能。然而，在特定游戏中这种功能可能让玩家执行不当行为，例如：利用存档取回他们已和其他玩家交易的物品、在输掉比赛时回复到线上排行榜中的更高级别等等。为了确保游戏的公平性，云端存档备份功能不会在这类游戏中推出。以确保玩家不会利用云端存档来不当地影响线上排名机制，因此也不会支援《Splatoon 2》。

确实就如任天堂所述，这类云端存档备份功能是有可能遭利用来进行作弊的。不过有玩家认为，任天堂直接不开放云端存档备份的决策根本是本末倒置，因为线上游戏其实可以利用官方伺服器数据追踪的方式来避免玩家出现利用存档的作弊行为，在防范作弊的同时也能够支持云端存档备份。