摘要：\u003C\u002Fp\u003E\u003Cdiv class=\"pgc-img\"\u003E\u003Cimg src=\"http:\u002F\u002Fp1.pstatp.com\u002Flarge\u002Fpgc-image\u002F1802dde976b345d38091915243009d30\" img_width=\"526\" img_height=\"138\" alt=\"直接在 DNA 上执行 SQL 操作，已通过 PostgreSQL 验证\" inline=\"0\"\u003E\u003Cp class=\"pgc-img-caption\"\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003C\u002Fdiv\u003E\u003Cp\u003E研究人员通过为 PostgreSQL 构建归档和恢复工具（pg_oligo_dump 与 pg_oligo_restore）证明 OligoArchive 可以在实践中实现，这些工具执行模式识别编码和解码 DNA 上的关系数据，并使用这些工具将 12KB TPC-H 数据库归档到 DNA，进行体外计算，并将其恢复。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cdiv class=\"pgc-img\"\u003E\u003Cimg src=\"http:\u002F\u002Fp9.pstatp.com\u002Flarge\u002Fpgc-image\u002Fd225fc2bc9dc4868b09c1d040f6e0d34\" img_width=\"500\" img_height=\"327\" alt=\"直接在 DNA 上执行 SQL 操作，已通过 PostgreSQL 验证\" inline=\"0\"\u003E\u003Cp class=\"pgc-img-caption\"\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003C\u002Fdiv\u003E\u003Cp\u003E论文研究了在数据库存储层次结构中集成 DNA 的问题。

"\u003Cdiv\u003E\u003Cp\u003E法国通信系统工程师学校与研究中心（Eurecom）数据科学系助理教授 Appuswamy 和伦敦帝国理工学院 SCALE 实验室负责人 Heinis 等人近期发表了一篇关于\u003Cstrong\u003E在 DBMS 存储层操作 DNA \u003C\u002Fstrong\u003E的论文《OligoArchive: Using DNA in the DBMS storage hierarchy》。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cdiv class=\"pgc-img\"\u003E\u003Cimg src=\"http:\u002F\u002Fp9.pstatp.com\u002Flarge\u002Fpgc-image\u002Fd225fc2bc9dc4868b09c1d040f6e0d34\" img_width=\"500\" img_height=\"327\" alt=\"直接在 DNA 上执行 SQL 操作，已通过 PostgreSQL 验证\" inline=\"0\"\u003E\u003Cp class=\"pgc-img-caption\"\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003C\u002Fdiv\u003E\u003Cp\u003E论文研究了在数据库存储层次结构中集成 DNA 的问题。更具体地，其提出了以下两个问题：\u003C\u002Fp\u003E\u003Cul\u003E\u003Cli\u003E数据库经验如何帮助优化 DNA 编码和解码？\u003C\u002Fli\u003E\u003Cli\u003E生化机制如何应用于对 DNA 操作进行体外、近数据的 SQL 查询处理？\u003C\u002Fli\u003E\u003C\u002Ful\u003E\u003Cp\u003E为了回答这两个问题，该研究引入了一个叫 \u003Cstrong\u003EOligoArchive \u003C\u002Fstrong\u003E的架构，这是一种使用基于 DNA 的存储系统作为关系数据库归档层的架构。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003EDNA 的存储系统简单讲也就是指基于 ATCG 这些碱基所组成的一套存储信息的方案，类比 0\u002F1 二进制，这种存储系统具有四进制。用 DNA 作为存储介质，优势是容量大与存储时间长，有数据指出 1 克 DNA 能够存储大约 2 拍字节，相当于大约 300 万张 CD；同时用 DNA 存储数据保存时间可能长达数千年；此外与硬盘、磁带等存储介质不同，DNA 不需要经常维护，而且在读取方式上，DNA 存储不涉及兼容性问题。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E天然存在的 DNA 是有两条核苷酸链的双螺旋结构，而用于数据存储的 DNA 是单链核苷酸序列，又叫寡核苷酸（oligo），它是使用每次一个核苷酸来组装 DNA 的化学过程合成的。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003EOligoArchive 架构通过\u003Cstrong\u003E将基于磁带的归档层替换为基于 DNA 的归档层\u003C\u002Fstrong\u003E来改变 DBMS 存储层次结构，论文具体介绍了数据库引擎和 DNA 存储设备之间的分工，以及 DNA 存储设备应在 OligoArchive 中使用的接口。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cdiv class=\"pgc-img\"\u003E\u003Cimg src=\"http:\u002F\u002Fp1.pstatp.com\u002Flarge\u002Fpgc-image\u002F8723adb9955a4ba994ad966d2e100c6b\" img_width=\"561\" img_height=\"300\" alt=\"直接在 DNA 上执行 SQL 操作，已通过 PostgreSQL 验证\" inline=\"0\"\u003E\u003Cp class=\"pgc-img-caption\"\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003C\u002Fdiv\u003E\u003Cp\u003E数据库与 DNA 存储分工是这样的：数据库系统执行关系数据和寡核苷酸序列之间的转换。在 put 操作期间，DNA 存储系统合成 DNA 链并将它们存储在库中；在 get 操作期间，对 DNA 链进行测序并将读数返回。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cdiv class=\"pgc-img\"\u003E\u003Cimg src=\"http:\u002F\u002Fp1.pstatp.com\u002Flarge\u002Fpgc-image\u002F1802dde976b345d38091915243009d30\" img_width=\"526\" img_height=\"138\" alt=\"直接在 DNA 上执行 SQL 操作，已通过 PostgreSQL 验证\" inline=\"0\"\u003E\u003Cp class=\"pgc-img-caption\"\u003E\u003C\u002Fp\u003E\u003C\u002Fdiv\u003E\u003Cp\u003E研究人员通过为 PostgreSQL 构建归档和恢复工具（pg_oligo_dump 与 pg_oligo_restore）证明 OligoArchive 可以在实践中实现，这些工具执行模式识别编码和解码 DNA 上的关系数据，并使用这些工具将 12KB TPC-H 数据库归档到 DNA，进行体外计算，并将其恢复。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E论文中的实验表明，使用合成 DNA 存档和恢复数据不仅可行，而且还可以利用数据库知识经验优化 DNA 编码和解码过程，甚至\u003Cstrong\u003E直接在 DNA 上执行 SQL 操作\u003C\u002Fstrong\u003E。\u003C\u002Fp\u003E\u003Cp\u003E具体内容查看论文：http:\u002F\u002Fcidrdb.org\u002Fcidr2019\u002Fpapers\u002Fp98-appuswamy-cidr19.pdf\u003C\u002Fp\u003E\u003C\u002Fdiv\u003E"'.slice(6, -6), groupId: '6717164514506179075