1996年在克罗地亚公布的关于战时损坏的官方数据指出180,000个被摧毁的住房单元，25％的克罗地亚经济被毁，以及270亿美元的物质损失。“ 欧洲评论2003/04”估计，受损基础设施，经济产出损失和难民相关成本的战争损失达370亿美元，而此期间国内生产总值下降了21％。

15％的住房单元和2,423个文化遗产结构，包括495个骶骨结构，被摧毁或损坏。[305]战争给军事支出带来了额外的经济负担。到1994年，随着克罗地亚迅速发展成事实上的战争经济，军队消耗了政府总支出的60％。

战争期间南斯拉夫和塞尔维亚的支出更加不成比例。1992年联邦预算提案将81％的资金转用于塞尔维亚战争。由于1992年之前联邦预算的很大一部分是由斯洛文尼亚和克罗地亚提供的，这是南斯拉夫最发达的共和国，缺乏联邦收入很快导致绝望的资金印刷，以资助政府运作。

这反过来又造成了历史上恶性通货膨胀最严重的一次：1993年10月至1995年1月，当时由塞尔维亚和黑山组成的南斯拉夫遭受了五亿亿的恶性通货膨胀。

许多克罗地亚城市遭到来自RSK或JNA部队的炮兵，导弹和飞机炸弹的攻击，这些部队来自RSK或塞尔维亚控制的波斯尼亚和黑塞哥维那地区以及黑山和塞尔维亚。

战争期间，克罗地亚的各个地区埋设了大约200万枚地雷。大部分雷区都没有任何图案或任何类型的记录由地雷的位置组成。战争结束十年后，2005年，沿着前线，沿着国际边界的一些部分，特别是在比哈奇附近，以及一些前JNA设施周围，仍有大约25万枚地雷被埋葬。

截至2007年，仍然包含或怀疑含有地雷的地区面积约为1,000平方公里（390平方英里）。[318]自战争开始以来，克罗地亚有超过1,900人被地雷炸死或炸伤，其中包括500多人在战争结束后被地雷炸死或受伤。

1998年至2005年期间，克罗地亚在各种排雷行动方案上花费了2.14亿欧元。截至2009年，所有剩余的雷场都有明显标记。在2015年欧洲移民危机期间，人们一直担心地雷会影响从塞尔维亚到克罗地亚的难民。