着名的中世纪主义者史蒂文·朗西曼在1954年写道：“从来没有比第四次十字军东征更大的反人类罪。”围绕第四次十字军东征的争议导致学术界对其目标是否确实是捕获的意见分歧君士坦丁堡唐纳德·E·奎勒和托马斯·F·马登在他们的着作“第四次十字军东征”（1977）中挑战了传统的立场，认为情况就是如此。

君士坦丁堡被认为是基督教的堡垒，它将欧洲从伊斯兰教的前进力量中捍卫出来，而第四次十字军东征对这座城市的劫掠对这座东部堡垒造成了无法挽回的打击。虽然希腊人在经过57年的拉丁统治后重新夺回了君士坦丁堡，但拜占庭帝国却因第四次十字军东征而陷入瘫痪。

减少到君士坦丁堡，安纳托利亚西北部和巴尔干南部的一部分，帝国落到了1453年占领该城市的奥斯曼土耳其人。

八百年后，教皇约翰保罗二世两次对第四次十字军东征的事件表示悲伤。 2001年，他写信给雅典大主教克里斯托多洛斯，“为了确保基督徒自由进入圣地的袭击者在信仰中反对他们的兄弟，这是悲惨的事实。

他们是拉丁基督徒填充的事实天主教徒深感遗憾。“2004年，当君士坦丁堡的族长巴塞洛缪一世访问梵蒂冈时，约翰保罗二世问道：”我们怎能不在八个世纪的距离内分享痛苦和厌恶。“ 这被认为是希腊东正教会对第四次十字军东征所犯下的大屠杀的道歉。

2004年4月，在关于城市被捕800周年的演讲中，巴塞洛缪的普世大主教正式接受了道歉。

“和解的精神比仇恨更强烈，”他在法国里昂的罗马天主教大主教Philippe Barbarin参加的礼仪仪式上说。

“我们感激并尊重你对第四次十字军东征悲惨事件的亲切姿态。事实上，800年前这座城市发生了犯罪事件。”巴塞洛缪说他的接受是以帕夏的精神来实现的。 “复活的和解精神......煽动我们与我们的教会和好。”

第四次十字军东征是教皇最后一次发动的主要十字军东征之一，尽管很快就失去了教皇的控制权。在非专业人士和教皇之间的争吵导致第五次十字军东征的崩溃之后，后来的十字军东征是由个别君主指挥的，主要针对埃及。

随后的一次十字军，第六次成功地使耶路撒冷恢复基督教统治15年。

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