一个学科不断成熟完善的标志之一便是研究方法的进步，民族教育学是一门相对年轻的学科，要想进一步发展必然需要采用不同学科领域的研究方法。当前，许多学者开始认识到人类学方法对于民族教育学研究的适用性，并不断引入到相关的研究中。上世纪，马尔库斯和费彻尔就提出人类学在今日影响日甚，其文化理念和独到的研究方法的影响已经贯穿到所有的社会科学领域，它也成为学科与学科之间理论和方法传播的渠道。

不仅是人类学的方法，民族教育学研究还可以借鉴历史学、语言学、法学以及自然科学的研究方法，将定性研究与定量研究相结合，避免囿于定性研究的经验描述和思辨分析，可将实验法、统计分析、因素分析甚至结合大数据分析的方法，提高民族教育学研究的可读性和严谨性。

当前，我国民族教育研究领域存在明显不平衡现象，同样通过中国知网数据库以民族教育为主题进行文献检索显示，民族教育研究中所占比例较大的主要是中等教育、成人与特殊教育、教育理论与教育管理等，而民族学前教育和民族职业教育、民族音乐舞蹈教育等处于非常弱势的地位，研究成果总量相当于民族中等教育研究成果的四分之一。

从横向领域看，民族教育学的研究集中在民族教育理论、民族教育教学与课程、民族教育史等方面，但在民族教育创新、民族教育评估等方面的研究较为薄弱。此外，民族教育研究主要涉及的是少数民族和民族地区教育的问题，关于新疆地区、西藏地区、宁夏回族地区、西南少数民族地区的研究较多，而中东部、东南部的少数民族地区研究相对较少。

我国的民族教育学应意识到民族教育的一般性与特殊性规律与特征，平衡民族教育研究的不同领域和方向，促进民族教育学学科体系的发展与完善，从而实现我国民族教育乃至整个教育事业的全面协调发展。