姜子牙打敗商紂王之後，在師尊的授意下要斬除九尾狐妖，卻意外地發現九尾狐妖身體裏有無辜元神。結果他一念之差，只斬除了九尾狐妖的肉身，而讓九尾狐妖的元神逃出去了。姜子牙因爲囿於九尾狐妖幻術而被師尊貶下北海修行，但他遇到了小狐仙小九，而小九一意孤行，要到黑花開放的幽都山尋找父王。姜子牙爲了揭開九尾狐妖的謎團，帶着小九同行，還有四不像護身，更有師弟申公豹的保護，向着幽都山進發。他們到了幽都山才知道，紂王被封爲姻緣神，而九尾狐妖已經元神復原，要抓住小九，解開小九腿上套的同命鎖。九尾狐妖向姜子牙透露一個祕密，那就是師尊爲了統治三界，讓九尾狐妖帶領狐族去打仗，答應給他們封神，結果最後師尊背信棄義，把狐族斬盡殺絕，九尾狐妖要找師尊報仇雪恨。姜子牙要問師尊“是保一人還是救蒼生？”而師尊的回答令姜子牙大失所望，“要救蒼生。”姜子牙的回答是“不保一人如何救蒼生？”他們師徒的爭論陷入了哈佛大學教授Michael J. Sandel講的“謀殺背後的道德邏輯”，不能自拔。

無疑，姜子牙所認爲的是對的，爲救身爲蘇妲己的小九，他敢於面對九尾狐妖的傷害，敢於和師尊鬧翻，最終打斷天梯，走向了反叛之路。那麼，神仙淨化系統就起了作用，姜子牙就成了神系淨化系統內部的紀律檢查人員，即使身爲師尊的頂高神也要接受道德和人心的約束，要經受善的考驗，而不是謀殺一人救了終生。

影片最後，姜子牙勝利了，師尊受到了上天懲罰，玄鳥降世，引渡世上的冤魂，世間恢復和平。但是，如此的大動干戈，連同姜子牙拼盡生命力的吶喊和反抗究竟驗證了什麼？驗證了公正和公義，驗證了善良和善心。神仙譜系就是依照世間官僚體系構建的，姜子牙淨化神仙系統的行爲恰似人間官員淨化官僚系統的行爲，何其艱難乃爾！