原标题：基于NEXT GEM技术的10x Genomics Chromium 系统全新出击

10x Genomics Chromium 系统自问世以来，以迅猛的势头助力科学家解析生命的奥秘，高分文章发发发不停，真是成果喜人！这次10x Genomics基于Next GEM技术，推出了新的Chromium 系统。而新的仪器及相关试剂，在技术参数方面与旧仪器完全一致，可以确保现有用户平稳过渡，所以老师们无需担忧，可以放心的投入使用！！！

—— Chromium Next GEM工作流程 ——

图1 Chromium Next GEM工作流程示意图

从工作流程示意图中，我们可以看出，在Chromium Next GEM系统中， Gel beads和细胞与反应所需试剂在第一个“十字交叉口”相遇后，一起进入油相，在油相里，细胞与Gel beads被油滴包裹，形成一个个独立的反应体系。这就是Chromium Next GEM较之前系统的最核心的不同之处。

—— Chromium Next GEM系统参数 ——

✔该系统每次运行提供8个通道，每个通道可以收集100-10000个细胞；

✔细胞捕获效率最高可达65%；

✔测序结果中 doublet比例为0.9%/1000个细胞；

✔细胞大小灵活，没有下限

—— Chromium Next GEM数据展示 ——

✔Chromium Next GEM Single Cell Gene Expression v3.1 与Chromium Single Cell Gene Expression v3数据相比，具有很高的一致性

图2 Chromium Next GEM Single Cell Gene Expression v3.1 与Chromium Single Cell Gene Expression v3细胞聚类分析及重叠细胞群

A. Next GEM Single Cell Gene Expression v3.1 与Chromium Single Cell Gene Expression v3细胞聚类分析表明二者技术差异很小（(蓝色的点表示 Single Cell Gene Expression v3的数据; 红色的点表示,Next GEM Single Cell Gene Expression v3.1的数据)

B. 使用Single Cell Gene Expression v3解决方案对10868个PBMC细胞进行t-SNE分析。

C. 使用Next GEM Single Cell Gene Expression v3.1解决方案对9683 个PBMC细胞进行t-SNE分析。

✔Chromium Next GEM Single Cell Immune Profiling Solution v1.1 和Single Cell Immune Profiling Solution表现相当

图3 Single Cell V(D)J Reagent Kits 和 Next GEM Single Cell V(D)J Reagent Kits v1.1 在人类PBMC，小鼠PBMC和卵巢癌组织中基因组表达数目及UMI对比显示，二者具有很高的一致性

✔Chromium Next GEM Single Cell ATAC Reagent Kit v1.1 与Chromium Single Cell ATAC Reagent Kit v1.0相比，批次效应很小，甚至没有

图4 Single Cell ATAC v1.0 和Next GEM Single Cell ATAC v1.1 数据比对分析，二者数据差异很小