通常情況下,確診肺癌時臨牀分期屬於“早期”的患者大多數可以進行手術治療,但哪怕進行了根治性手術,早期患者依舊要面臨一個新的問題——腫瘤復發風險,這就引入了我們今天的主題——MRD (Minimal Residual Disease,微小殘留病竈)。

隨着中國首個《肺癌MRD的檢測和臨牀應用共識》出爐,MRD成爲了一個大熱門,很多基因檢測公司也都有了自己的MRD檢測產品。今天我們就來看看MRD到底是什麼。

PART 1

MRD的檢測意義

MRD的全稱是“微小殘留病竈”,是指早中期癌症患者在經過根治性治療後,體內的隱匿性微轉移或微小殘留病竈。

MRD是腫瘤復發和遠端轉移的潛在來源,主要通過檢測術後外周血中的ctDNA含量,去判斷MRD陽性還是陰性:

MRD+陽性=復發風險高;

MRD-陰性=復發風險低。

不僅僅是在肺癌,MRD在結直腸癌、乳腺癌、食管癌等多種實體瘤中都具有很好的預後價值。

PART 2

易混淆的概念:ctDNA和MRD的關係

前面說主要通過測“ctDNA含量”去判斷是否存在微小殘留病竈,那麼只要是測ctDNA就是在測MRD嗎?

當然不是的。

我們需要先介紹一個概念——ctDNA的檢出限(LOD),比如LOD是0.1%,意味着ctDNA含量≥0.1%的時候,能被檢測到,所以LOD是有效檢測的最低值。

而檢測ctDNA可以應用於不同的腫瘤診療的場景,不同用途對ctDNA的檢出限(LOD)要求是不一樣的。

當用ctDNA含量作爲“分子診斷”的依據時,對ctDNA的檢出限要求是0.1%的水平。

當用ctDNA含量作爲微小殘留病竈(MRD)的陽性陰性的主要判讀標誌時,對檢出限的要求會更嚴苛。

什麼樣的MRD檢測算是好的呢?

我們舉一個理想狀態下的極限案例:在ctDNA含量無限低的情況下,還能被檢測到。我們認爲這是一個極限優秀的MRD檢測。

但ctDNA含量無限低,被檢測到的可能性也無限低,所以在二者之間尋求了一個平衡,國內首個《肺癌MRD的檢測和臨牀應用共識》中提出,用作MRD檢測的時候,ctDNA的檢出限需要低至0.02%的水平,以0.02%作爲臨界,檢出限越低是越好的,檢出限越低意味着在ctDNA含量很少的情況下,也能被檢測到。

如果一個MRD產品的檢出限高於0.02%,意味着它只能在ctDNA含量高於0.02%的時候纔可能測到ctDNA,它測到的所謂“微小”殘留病竈,可能並不那麼“微小”了。

小結:能檢測ctDNA≠能檢測MRD,當ctDNA檢出限至少低到0.02%的水平還能穩定檢出ctDNA=能檢測MRD。

PART 3

肺癌MRD檢測

MinerVa MRD Assay

前面我們說到的檢出限LOD至少低至0.02%,只是實現有意義的MRD檢測的基礎,在這個基礎之上,綜合了當前的技術手段、成本效益、檢測難度等各個方面,MinerVa MRD Assay是如何檢測肺癌的微小殘留病竈的呢?

每個肺癌患者的腫瘤突變譜都是不一樣的,MinerVa MRD Assay採取組織先驗的方式,針對每個患者的腫瘤突變譜實現個性化追蹤。

第一步:送檢患者的手術組織和與之匹配的血液,檢測700+個腫瘤相關基因的變異信息,形成每個患者的個性化基因變異圖譜,以該變異圖譜爲基礎,追蹤患者的突變;

第二步:在手術後1月,再次送檢血液樣本,在血漿中追蹤“第一步”中檢出的突變,臻和科技MinerVa平臺進行分析後出具MRD陽性/陰性結果:

MRD+陽性=復發風險高;

MRD-陰性=復發風險低。

PART 4

MinerVa MRD Assay值得信賴的原因

在ctDNA檢出限達標的前提下,追蹤哪些變異?如何找到這些變異?追蹤的這些變異是不是準確?MRD陰性/陽性的判讀結果是否靠譜?

這正經是一項“技術活”。

首先,我們會先基於組織樣本檢測出的變異結果,形成每個患者專屬的變異圖譜,並進行個性化追蹤。

接下來的問題是,我們如何保障可追蹤的變異數量呢?

如果第一步組織檢測時覆蓋的突變足夠多,就能儘可能提高可追蹤的變異數量;對組織樣本進行檢測時,臻和能覆蓋700+個腫瘤相關基因,而當前已知的國內同類型MRD檢測產品中,覆蓋的腫瘤相關基因基本都在300以內。

那我們如何選擇追蹤哪些變異呢?

MinerVa在變異追蹤的廣度與深度上做了更合理優化的設計:

廣度:覆蓋熱點驅動突變+克隆性的無功能搭車變異

深度:差異權重的Panel設計,肺癌熱點區域加倍覆蓋深度。

追蹤到變異後,我們如何去判讀是否存在微小殘留病竈呢?如何保障我們的報出結果是可靠的?

獨家算法:MinerVa的算法是臻和科技獨家開發的“多位點聯合置信度概率 分析算法”,是檢測特異性的保障。換句話說,臻和科技MinerVa判讀一個患者的MRD檢測結果的準確性,是有保障的。

也是基於此研究結果,我們認爲術後1月是圍手術期ctDNA檢測預測患者復發的最佳時機,所以在臻和科技進行MRD檢測時,我們將再次送檢血液進行檢測的時間定爲手術後1月。

全文小結

1. MRD檢測是新興的預測腫瘤術後復發風險的檢測;

2. 主要通過檢測術後血漿ctDNA含量去判斷MRD是陰性還是陽性;ctDNA作爲肺癌MRD檢測的標誌物時,檢出限需要低到0.02%(國內專家共識)。

3.臻和科技肺癌MRD產品MinerVa MRD Assay採取組織先驗的方式,700+基因panel爲每個患者提供個性化追蹤突變;

4. MinerVa MRD Assay的臨牀預後驗證有全球最大樣本量的早期肺癌MRD研究——LUNGCA做支持。

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