05 月 04 日的《熱心腸日報》,我們解讀了 9 篇文獻,關注:炎症相關結直腸癌,腸道病毒,新冠病毒,新冠疫苗,飲食-免疫互作,急性腹瀉,噬菌體療法。

Nature Reviews Immunology——[40.358]

① 慢性炎症通過產生活性氧以誘導DNA損傷或表觀遺傳變化,從而導致炎症相關的腫瘤發生;② 腫瘤進展引發的炎症應答導致低氧誘導細胞死亡及腸道屏障破壞,以起到腫瘤促進作用;③ 腫瘤治療誘導的炎症通過壞死細胞釋放的DAMP促進腫瘤進展;④ 腸道細菌及其代謝產物通過誘導突變、增強腫瘤促進性炎症應答、招募免疫抑制細胞等方式促進結直腸腫瘤發生;⑤ 腸道真菌也可通過誘導腫瘤促進性炎症微環境或產生真菌毒素誘導突變,從而促進結直腸腫瘤發生。

【主編評語】

炎性微環境在結直腸腫瘤發生中發揮了重要作用,結直腸癌的發生、進展及預後均受到腫瘤微環境中的免疫細胞及基質細胞的顯著影響。Nature Reviews Immunology上發表的一篇綜述文章,詳細介紹了炎症參與調控結直腸癌的發生發展的三種方式:炎症相關腫瘤發生、腫瘤誘發的炎症、治療誘發的炎症,並討論了飲食、腸道細菌及腸道真菌在炎症相關結直腸癌中的作用機制。(@szx)

【原文信息】

The inflammatory pathogenesis of colorectal cancer

2021-04-28, doi: 10.1038/s41577-021-00534-x

Gastroenterology——[17.373]

① 收集31名IBD-CRC患者的腫瘤組織及正常結腸組織;② IBD-CRC中經典上皮腫瘤亞型常見的WNT信號缺失,而間充質基質富集;③ 相比於sCRC,IBD-CRC中的AXIN2及RNF43(WNT信號負調控因子)顯著下調,HNF4A(WNT誘導的上皮間充質轉化的負調控因子)獲得減少;④ 僅在sCRC中檢測到HNF4α結合位點的低甲基化富集,而IBD-CRC中PIGR及OSMR(參與粘膜免疫)的啓動子甲基化失調;⑤ IBD-CRC中的TP53 5’UTR區域突變富集,APC及KRAS的體細胞突變較少。

【主編評語】

IBD與結直腸癌風險增加相關。與散發性結直腸癌(sCRC)相比,IBD相關結直腸癌(IBD-CRC)可能有着不同的腫瘤發生通路。來自Gastroenterology上發表的一項最新研究,對IBD-CRC患者的腫瘤組織中的遺傳及表觀遺傳特徵進行了鑑定,並與sCRC進行了對比。(@szx)

【原文信息】

Genetic and epigenetic characteristics of inflammatory bowel disease associated colorectal cancer

2021-04-26, doi: 10.1053/j.gastro.2021.04.042

Cell Host and Microbe——[15.923]

① 選取來自6個科的10株腸道真核病毒感染小鼠,除小RNA病毒科的CVB3之外,其它病毒感染後小鼠無症狀;② 部分病毒感染的強度和持續時間取決於腸道細菌,多種病毒在無菌小鼠腸道中的定殖增強;③ 病毒感染誘導腸道免疫系統的持久變化(淋巴細胞分化、IL-22產生、持續的病毒株特異性應答);④ 病毒株特異性應答伴隨着共同的IL-22和Th1介導的免疫應答;⑤ 對比病毒感染與細菌定殖後的小鼠腸道轉錄組,部分病毒與部分細菌可誘導相似的腸道免疫應答。

【主編評語】

Cell Host and Microbe上發表的一項最新研究,利用6個病毒科的10株腸道真核病毒感染小鼠,發現無症狀的病毒感染可誘導持久的腸道免疫應答,包括病毒株特異性的應答及非病毒株特異性的共同應答(例如IL-22的產生)。另外,對比了病毒感染與細菌定殖後的小鼠腸道轉錄,鑑定出了病毒與細菌誘導的腸道免疫應答的相似之處與不同點。(@szx)

【原文信息】

Enteric viruses evoke broad host immune responses resembling those elicited by the bacterial microbiome

2021-04-23, doi: 10.1016/j.chom.2021.03.015

Gut——[19.819]

① 腸道病毒組在維持腸道健康穩態中發揮重要作用;② 在炎症性腸道疾病(IBD、IBS、腸道移植物抗宿主病)及結直腸癌中,腸道病毒組發生改變;③ 腸道可作爲HIV2的蓄水池,83%–95%的HIV感染細胞位於腸道中,並可通過免疫細胞遷移到達淋巴結及血液中;④ 腸道還可作爲SARS-CoV-2的蓄水池:SARS-CoV-2可感染腸道上皮細胞,從而導致記憶B細胞及記憶T細胞的持續活化;⑤ 進行糞菌移植時,應考慮供體的腸道病毒組。

【主編評語】

Gut上發表的一篇綜述文章,介紹了在炎症性腸道疾病及腸道腫瘤中的腸道病毒組變化,並討論了腸道作爲病毒(HIV及SARS-CoV-2)蓄水池的機制。(@szx)

【原文信息】

Gut as viral reservoir: lessons from gut viromes, HIV and COVID-19

2021-04-26, doi: 10.1136/gutjnl-2021-324622

Gut——[19.819]

① 納入865名接受英夫利昔單抗治療及428名接受vedolizumab治療的IBD患者,對比接種新冠疫苗後的抗體應答及血清轉換率;② 無論接種的是BNT162b2還是ChAdOx1 nCoV-19,英夫利昔單抗組患者的抗新冠病毒抗體平均濃度均顯著低於vedolizumab組患者;③ 年齡≥60歲、免疫調節劑使用、克羅恩病(相比於潰瘍性結腸炎及未分類IBD)及吸菸與較低的抗新冠病毒抗體濃度相關,而非白人種族與較高的抗新冠病毒抗體濃度相關;

【主編評語】

來自Gut上發表的一項最新研究,發現無論接種哪種新冠疫苗——BNT162b2(輝瑞/BioNTech共同研發)及ChAdOx1 nCoV-19(牛津大學/阿斯利康共同研發),接受英夫利昔單抗治療的IBD患者的抗新冠病毒抗體濃度均顯著低於接受vedolizumab治療的IBD患者。該研究結果建議,接受英夫利昔單抗治療的IBD患者應在最佳接種時間接種兩劑新冠疫苗。(@szx)

【原文信息】

Infliximab is associated with attenuated immunogenicity to BNT162b2 and ChAdOx1 nCoV-19 SARS-CoV-2 vaccines in patients with IBD

2021-04-26, doi: 10.1136/gutjnl-2021-324789

Molecular Systems Biology——[8.991]

① 對SARS-Cov-2感染的人類結腸和迴腸類器官進行單細胞轉錄組測序,發現僅7-10%的腸上皮細胞在24h時被感染,且與IFNλ2-3表達上調有關;② 未成熟的腸上皮細胞2亞羣是病毒主要靶向感染細胞,且ACE2表達水平與細胞的易感性缺乏正向的相關性;③ SARS-Cov-2感染下調細胞ACE2的表達,誘導促炎反應,並誘導IFN以旁分泌的方式作用於旁觀者細胞;④ 而SARS-Cov-2抑制感染細胞的JAK-STAT通路,抑制其IFN介導反應,對IFN產生耐藥性。

【主編評語】

過度的促炎免疫反應有助於COVID-19的病理發生。Molecular Systems Biology近期發表的文章,通過對SARS-CoV-2感染的人類結腸和迴腸類器官進行單細胞轉錄組測序分析,鑑定出一個腸細胞亞羣是SARS-CoV-2的主要感染靶點,且ACE2的表達與感染的易感性之間缺乏正相關性。感染的細胞誘導強烈的促炎反應和表達IFN,同時下調ACE2表達,而IFN以旁分泌的方式作用於旁觀者細胞上調幹擾素誘導基因的表達。(@愛的抉擇)

【原文信息】

Single‐cell analyses reveal SARS‐CoV‐2 interference with intrinsic immune response in the human gut

2021-04-27, doi: 10.15252/msb.202110232

Circulation——[23.603]

① 在小鼠和人巨噬細胞中,胞外鈉被攝取到胞內以抑制線粒體呼吸;② 高鹽可降低線粒體膜電位、電子傳遞鏈複合物II的活性、耗氧量及ATP產生,與巨噬細胞的極化狀態無關;③ 高鹽處理可增強M1巨噬細胞的殺菌功能,而減少M2型巨噬細胞誘導的CD4+ T細胞遷移;④ 正常鹽濃度下,破壞電子傳遞鏈可複製高鹽誘導的人及小鼠單核吞噬細胞的轉錄變化及殺菌功能增強;⑤ 14天/單餐高鹽攝入後,健康人的血漿鈉分別升高2mM和2.3mM,單核細胞的線粒體耗氧量降低。

【主編評語】

高鹽攝入是死亡及發病的主要風險因素之一。餐後的血清鈉水平短暫升高,並可在炎症部位積累,以影響先天性及適應性免疫細胞的分化及功能。來自Circulation上發表的一項最新研究,發現高鹽可抑制小鼠及人單核細胞的線粒體呼吸,從而增強M1巨噬細胞的殺菌功能,同時抑制M2巨噬細胞的免疫抑制作用。在2項健康人蔘與的試驗中,14天或單餐的高鹽攝入可顯著增加血漿中的鈉水平,並降低單核細胞的線粒體耗氧量。(@szx)

【原文信息】

Salt Transiently Inhibits Mitochondrial Energetics in Mononuclear Phagocytes

2021-04-28, doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.120.052788

Nature Communications——[12.121]

① 收集2009-2018年間152,792名中國急性腹瀉患者的數據;② A型輪狀病毒及諾如病毒是最常見的病毒病原體,其次是腺病毒及星狀病毒;③ 致腹瀉性大腸桿菌及非傷寒沙門氏菌是最常見的細菌病原體,其次是志賀氏菌及副溶血弧菌;④ 痢疾阿米巴是最常見的寄生蟲病原體,其次是藍氏賈第鞭毛蟲及隱孢子蟲;⑤ 5歲以下的患者中更常見病毒病原體,18-45歲的患者中更常見細菌病原體;⑥ 季節及地理因素影響病原體感染,不同病原體感染的臨牀特徵有所差異。

【主編評語】

安徽醫科大學的方立羣團隊、北京大學的Wei Liu團隊及疾控中心的李忠傑團隊在Nature Communications上發表的一項最新研究,通過收集2009-2018年間超過15萬名中國急性腹瀉患者的病原學、流行病學及臨牀數據,鑑定出了各種腸道病原體感染(包括病毒、寄生蟲、細菌)的比例,發現不同病原體感染導致的臨牀特徵有所差異,且季節及地理因素對感染的病原體種類有所影響。該研究結果爲制定中國急性腹瀉的防治策略提供了參考。(@szx)

【原文信息】

Etiological, epidemiological, and clinical features of acute diarrhea in China

2021-04-29, doi: 10.1038/s41467-021-22551-z

Microbiome——[11.607]

① 一名金黃色葡萄球菌感染患者接受4周的噬菌體療法(AB-SA01,含有3種抗葡萄球菌噬菌體)+全身抗生素治療;② 期間收集患者的糞便、皮膚及唾液樣本,並與美國腸道項目中的健康人羣、抗生素治療人羣及ICU人羣的菌羣聯合分析;③ 患者的腸道和唾液菌羣未隨時間發生顯著變化,腋窩皮膚樣本中的金黃色葡萄球菌明顯減少;④ 代謝產物表現出因噬菌體療法而發生的短暫的顯著變化;⑤ 僅在血液(而非唾液、糞便及皮膚)中檢測到所使用的噬菌體的基因組。

【主編評語】

噬菌體療法可用於治療嚴重細菌感染,但其對宿主菌羣的影響尚未明確。來自Microbiome上發表的一項案例分析,對一名接受噬菌體療法(Armata Pharmaceuticals公司的AB-SA01)的金黃色葡萄球菌感染患者的糞便、皮膚及唾液樣本進行縱向分析,發現在治療期間,糞便及唾液菌羣組成未發生顯著變化,而腋窩皮膚中的葡萄球菌屬顯著減少,可能歸因於噬菌體療法造成的金黃色葡萄球菌減少。(@szx)

【原文信息】

Assessment of the microbiome during bacteriophage therapy in combination with systemic antibiotics to treat a case of staphylococcal device infection

2021-04-14, doi: 10.1186/s40168-021-01026-9

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