作爲目前中國男籃以及CBA頂級內線，周琦卻始終充滿了爭議，好不容易在國家隊證明了自己，卻又與老東家新疆男籃鬧出了不可調節的矛盾，之前周琦就多次暗示不滿新疆男籃，隨後阿的江也公開回應，並且還保護了周琦，然而讓人沒有想到的時候，周琦的經紀人睢冉公開炮轟CBA，另外據瞭解，周琦也拒絕了新疆男籃的頂薪合同，如果鬧劇繼續下去的話，周琦不排除被CBA公司禁止註冊的可能！

當初爲了高薪，周琦拒絕遼寧男籃一度引起了不小的轟動，在新疆男籃，周琦成爲了重點照顧的對象，只要提出要求，新疆男籃方面都能夠解決。幫助新疆男籃奪冠之後，周琦也去NBA打球，新疆男籃沒有任何阻攔，這也獲得了球迷的好評。然而隨後周琦從NBA迴歸，想要加盟遼寧男籃，這引起了新疆男籃的不滿，最終中國籃協判定周琦必須迴歸新疆男籃。

就在這個時候，睢冉成爲了周琦的經紀人，他一度表示希望周琦去歐洲打球，當然，這也是給新疆男籃聽的，最終新疆男籃董事長侯偉親自去北京與周琦以及睢冉進行了溝通，雙方簽訂了新的合同。過去兩個賽季，新疆男籃成績的確不是非常理想，周琦也非常辛苦，多次帶傷堅持比賽，可CBA所有當家球星幾乎都這樣，廣東宏遠的易建聯，遼寧男籃的郭艾倫，誰不是一身傷病？

上賽季結束之後，周琦與新疆男籃合同到期，然而周琦卻不斷暗示甚至炮轟新疆男籃，這也引起了熱議，隨後新疆男籃主帥阿的江進行了回應，話裏話外都是幫助周琦說話，可睢冉卻再次公開炮轟CBA業餘，暗示周琦遭遇了不公平的待遇。據瞭解新疆男籃給周琦開出了頂續約合同，但沒有高額的簽證費，周琦方面認爲這樣的條件沒有達到預期，所以始終拒絕簽約。

周琦團隊的確非常會挑時間，周琦剛在國家隊表現出色，也是有本錢與新疆男籃叫板。根據CBA公司方面透露，如果周琦拒絕新疆男籃的頂薪續約合同，並且不認可被申訴被駁回，那麼最糟糕的情況就是周琦被CBA公司拒絕註冊，畢竟如果打開了這個口子，那麼未來將會有更多的大牌球員要挾老東家。