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新海南客戶端、南海網、南國都市報8月4日消息(記者王洪旭 實習生羊祖燕)“儀器檢測正常”“實驗室已準備好!”……8月1日,海南省海口市發現1例外省輸入本土新冠肺炎確診病例(輕型),當天上午10點多,海南醫學院接海南省新冠疫情防控工作指揮部通知,要求儘快確認該病例毒株來源及遺傳特徵,爲疫情防控決策提供科學依據。接到通知後,海南醫學院新冠病毒測序專家組立即響應,一場與時間賽跑的攻堅戰打響。

經過26小時的“戰鬥”,專家們完成確診病例基因測序溯源,初步確認該毒株屬於印度德爾塔(Delta)變異株。

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝

8月4日,新海南客戶端、南海網、南國都市報記者專訪海南醫學院新冠病毒測序專家組成員。記者 李昊 攝

9名專家快速集結 有的遠程參與

新冠病毒基因測序,相當於給病毒做“親子鑑定”,溯源結果可爲全省疫情防控策略提供重要科學依據。

1日上午,接到通知後,海南醫學院黨委書記楊俊、校長趙建農立即指揮協調,將已經放暑假的專家快速集結,組織專車運送標本,啓動設備,開啓測序工作程序。

海南醫學院新冠病毒測序小組微信羣,也頓時熱鬧起來,9名專家各司其職。海南醫學院副校長、新冠病毒測序小組執行組長呂志躍說:“大家儘快啓動相關工作,安全規範操作。”

記者採訪海南醫學院副校長、新冠病毒測序小組執行組長呂志躍。記者 李昊 攝

“當時我在儋州,收到消息我就立即趕回海口。”海南醫學院熱帶轉化實驗室博士生任廣旭說,雖然已經放暑假,但他隨時待命,只要有需要就立即投入工作。他主要負責新冠病毒核酸標本的轉運,需專車專人完成,此前的兩次標本轉運也是由他完成。

任廣旭說,新冠病毒核酸標本轉運需要用負壓型轉運車冷鏈運輸,其中標本箱的溫度要保持在4℃以下,如果發現溫度有升高,要及時加冰降溫。

測序成員易國輝、張雲霞、方星悅在海口,他們立即回學校投入工作,先做好實驗室環境消殺、啓動實驗室儀器。

當時,海南醫學院生物醫藥資源大數據中心李永生教授,遠在黑龍江省哈爾濱市,通過遠程參與數據分析,博士生潘濤在海南醫學院配合李教授,實現無縫銜接,開展數據分析。

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝

夜以繼日 26小時完成基因測序溯源

8月1日下午6點,任廣旭將新冠病毒核酸標本hu-1運送至海南醫學院P2實驗室,早已做好準備的測序成員易國輝、張雲霞、方星悅立即投入工作,建庫、質檢、上機......

海南醫學院科學實驗中心副研究員易國輝說:“新冠病毒經過滅活後提取的核酸,是沒有傳染性的,在學校實驗室做也比較安全。採用高通量測序技術對新冠病毒溯源,關鍵的環節是對新冠病毒核酸富集,由於海口本例確診病例病毒核酸檢測ct爲19,病毒載量較高,操作起來速度比較快。”

易國輝說,從1日下午6點進入實驗室,晚上12點將標本放上機器進行測序。每一個環節都安全、規範、嚴謹而流暢,20個小時即獲得了高質量測序數據。

記者採訪海南醫學院科學實驗中心副研究員易國輝。記者 李昊 攝

獲得數據後,測序隊員第一時間將數據送往數據分析室,李永生、尹飛飛對數據進行過濾、拼接、可靠性驗證後開展序列比對及進化樹構建分析,最終數據及檢測報告由呂志躍副校長進行解讀及審覈,初步確認該毒株屬於印度德爾塔(Delta)變異株。8月2日晚,海南醫學院正式向海南省新冠疫情防控工作指揮部和海南省衛健委報送了檢測報告。

記者採訪海南醫學院熱帶轉化醫學教育部重點實驗研究員尹飛飛。記者 李昊 攝

2日晚上11點多,海南省衛健委向社會發布消息:經對陽性樣本基因測序,初步判定爲德爾塔(Delta)變異株。

“感謝各位組員夜以繼日,測序準確高效。”呂志躍說,本次溯源工作之所以能在26小時內高效完成,一方面得益於校領導的高度重視和積極協調,增加專家力量,保證工作開展,另一方面在於海醫測序小組專家24小時連軸工作,以最快速度對輸入性病例進行測序溯源。

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝

關鍵時刻顯擔當 多次高質量完成新冠病毒溯源

經瞭解,海南醫學院新冠病毒測序小組成立於2020年8月,目前擁有二代測序和三代測序兩個測序平臺,組成了一支包括病毒核酸轉運、病毒測序、生物信息學分析等成員的專業團隊。該團隊成立以來,申請獲得海南省新冠病毒核酸運輸及測序資質,多次高質量完成海南省新冠疫情防控工作指揮部交辦的多起新冠病毒核酸測序任務。

去年10月,對來自境外的一名母親和女兒進行核酸樣本採集,完成測序鑑定;今年4月,對多名外籍船員採集核酸樣本,開展基因測序和溯源,爲當時疫情防控提供有力支撐。

呂志躍提醒,德爾塔變異株具有傳播速度快、傳染能力強、感染早期症狀不明顯等特點,公衆們一定要提高警惕,做好個人防護,要戴好口罩、減少非必要外出、少參加聚集性活動;要及時接種疫苗,可以很好地保護自己和他人。

“針對新冠病毒的測序和溯源,可爲海南省疫情防控提供關鍵的科學依據。”呂志躍表示,海南醫學院病毒測序小組不僅可以對新冠病毒進行測序溯源,還可以對埃博拉、禽流感、登革熱等其他突發、新發、輸入性傳染病的病原體進行快速、精準的鑑定和溯源。

關鍵時刻顯擔當,爲疫情防控貢獻智慧。目前,海南醫學院在學校黨委領導和統籌部署下搭建了基因測序的技術平臺,擁有技術儲備、人才儲備。實行“平戰結合”的原則,測序成員平時開展各自承擔的教學、科研和臨牀工作,一旦有突發新發輸入性、傳染性病例,可以第一時間響應,第一時間投入到測序和溯源工作中。

海南醫學院新冠病毒測序專家組成員在做確診病例基因測序工作。記者 李昊 攝南海網版權聲明:

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