1791年，廓尔喀侵略军（今尼泊尔）第二次入侵西藏，这个时候的清朝在西藏驻军比较少，所以廓尔喀军队一路长驱直入，一直打到后臧地区，这里小编要解释一下什么是后藏地区，历史上西藏分前藏和后藏，前藏（以拉萨为中心）是达赖的地盘，后藏（以日喀则为中心）是班禅的地盘。

面对廓尔喀军队的入侵，乾隆急调大将军福康安率1万多名清军入藏。福康安这个人是一个杰出的军事家，他深知情况危急，率军每天强行军18小时，用了不到40天的时间火速入藏，清军的迅速行动大大出乎廓尔喀侵略军的预料，廓尔喀人被打了个措手不及，在一系列战斗中，清军“六战六捷，杀敌四千，收复后藏”。

事情并没有到此结束，为了永绝后患，福康安指挥军队继续追击，乘胜打过了喜马拉雅山，兵临尼泊尔都城加德满都城下。迫使廓尔喀臣服清朝，并发誓永不入藏。这就是乾隆十全武功的最后一件，两征廓尔喀。

这次征讨廓尔喀不仅保家卫国，粉碎了廓尔喀染指西藏的企图，更是顺带创造了一件标榜千古的事迹——制定《钦定藏内善后章程》，此章程规定了驻藏大臣与达赖喇嘛地位平等。并制定"金瓶掣签”制度，来认定达赖、班禅的转世灵童，极大的加强了中央政府对西藏的管控力。

而这个章程的创立都要归功于福康安，福康安虽然在西藏待了仅仅四个月，但他敏锐的感觉到西藏的种种弊端，特别是中央政府对西藏的管理必须加强，正是在他的主持下，向乾隆上疏了西藏善后十八事，最后由乾隆帝审定颁布了《钦定藏内善后章程》，内容覆盖了西藏地方行政、宗教、军事、司法、外事、财税、铸币等各个方面，从宏观到具体，无不详尽。

而且《钦定藏内善后章程》绝对不是摆设，在涉关对外事务及内部重大事项时，更是以“不经驻藏大臣同意，不可……”，“……都得服从驻藏大臣”，“……更要根据驻藏大臣的指示”，“……也须请驻藏大臣查阅”，“……，除非请示驻藏大臣同意，不得……”等不容置疑的文字着重突出了驻藏大臣在西藏事务中的权力，这在中国历史上是罕见的强硬！

至于现在有人批评说乾隆的所谓"十全武功"，是一个好大喜功者的幻想，很多人对乾隆的十全武功嗤之以鼻。的确，乾隆确实有穷兵黩武之嫌，但是乾隆时期的几次对外战争，保障了中国领土的完整和国家的统一，在这一点上，乾隆的功绩不可抹杀。