1791年，廓爾喀侵略軍（今尼泊爾）第二次入侵西藏，這個時候的清朝在西藏駐軍比較少，所以廓爾喀軍隊一路長驅直入，一直打到後臧地區，這裏小編要解釋一下什麼是後藏地區，歷史上西藏分前藏和後藏，前藏（以拉薩爲中心）是達賴的地盤，後藏（以日喀則爲中心）是班禪的地盤。

面對廓爾喀軍隊的入侵，乾隆急調大將軍福康安率1萬多名清軍入藏。福康安這個人是一個傑出的軍事家，他深知情況危急，率軍每天強行軍18小時，用了不到40天的時間火速入藏，清軍的迅速行動大大出乎廓爾喀侵略軍的預料，廓爾喀人被打了個措手不及，在一系列戰鬥中，清軍“六戰六捷，殺敵四千，收復後藏”。

事情並沒有到此結束，爲了永絕後患，福康安指揮軍隊繼續追擊，乘勝打過了喜馬拉雅山，兵臨尼泊爾都城加德滿都城下。迫使廓爾喀臣服清朝，併發誓永不入藏。這就是乾隆十全武功的最後一件，兩徵廓爾喀。

這次征討廓爾喀不僅保家衛國，粉碎了廓爾喀染指西藏的企圖，更是順帶創造了一件標榜千古的事蹟——制定《欽定藏內善後章程》，此章程規定了駐藏大臣與達賴喇嘛地位平等。並制定"金瓶掣籤”制度，來認定達賴、班禪的轉世靈童，極大的加強了中央政府對西藏的管控力。

而這個章程的創立都要歸功於福康安，福康安雖然在西藏待了僅僅四個月，但他敏銳的感覺到西藏的種種弊端，特別是中央政府對西藏的管理必須加強，正是在他的主持下，向乾隆上疏了西藏善後十八事，最後由乾隆帝審定頒佈了《欽定藏內善後章程》，內容覆蓋了西藏地方行政、宗教、軍事、司法、外事、財稅、鑄幣等各個方面，從宏觀到具體，無不詳盡。

而且《欽定藏內善後章程》絕對不是擺設，在涉關對外事務及內部重大事項時，更是以“不經駐藏大臣同意，不可……”，“……都得服從駐藏大臣”，“……更要根據駐藏大臣的指示”，“……也須請駐藏大臣查閱”，“……，除非請示駐藏大臣同意，不得……”等不容置疑的文字着重突出了駐藏大臣在西藏事務中的權力，這在中國歷史上是罕見的強硬！

至於現在有人批評說乾隆的所謂"十全武功"，是一個好大喜功者的幻想，很多人對乾隆的十全武功嗤之以鼻。的確，乾隆確實有窮兵黷武之嫌，但是乾隆時期的幾次對外戰爭，保障了中國領土的完整和國家的統一，在這一點上，乾隆的功績不可抹殺。