兩者還是有所不同的。主要有以下幾點。

報考條件

1，軍隊在職幹部，已獲得大學本科學歷，任職崗位、年限及報考專業等要符合軍隊規定，由所在師（旅）級單位政治機關審批，軍級單位政治機關覈准，上報軍委政治工作部幹部局備案，持師（旅）級單位幹部部門介紹信報名。

2，軍隊院校應屆本科畢業生，培養目標爲非指揮幹部的，報考專業符合軍隊規定，由所在院校訓練部門出具介紹信。而且軍隊院校應屆本科畢業生不得報考軍事學科專業（不含軍隊指揮一級學科下的軍事情報學，軍事信息學，作戰環境學）和軍事碩士專業學位研究生。

畢業任職

1，軍隊在職幹部考上研究生後，在學校學習，但是其有關的職務和軍銜晉升學校是不管的。其職務和軍校仍然有所在單位管理。由於軍官在院校學習，沒有在原單位工作，可能在職務晉升方面，單位相對來說對他考慮的比較少，可能會優先晉升哪些一直在單位工作的軍官。

2，軍校應屆畢業生考上軍校研究生的，在研究生期間，享受中尉副連職待遇，也就是每個月都有中尉副連相對應的工資，但是仍然佩戴學員銜。畢業後和本科生長幹部一樣統一分配工作，第一任職崗位爲排長，碩士研究生授上尉軍銜，享受正連職待遇。

軍隊在職幹部考研就是一個學歷提升的過程，而且對於指揮類的軍校學員是不允許畢業後就考研的，所以只能在部隊幹一段時間後考研究生。而對於非指揮類學員，考研即可以提升自己的學歷，又可以讓自己少奮鬥幾年就比同批本科畢業的同學早步入正連的行列。畢竟有好多人在中尉副連上都呆了好長時間（7/8年的都有）。