巢脾是養蜂場重要的生產資料。從蜂羣中抽出的巢脾，極易受潮生黴，或遭受老鼠和巢蟲危害，並易弓|起盜蜂騷擾。因此必須及時加以完善保管。剛搖出蜜的空脾，一定要放回巢箱隔板外或繼箱裏，讓蜜蜂將殘餘蜜汁舐吸乾淨後， 才能收存。巢脾應當保存在乾燥清潔的地方，其樓上、樓下及鄰室，都不能貯藏農藥，避免適成蜂羣中毒。另一方面，巢脾也要進行燻蒸消毒，因此也不宜靠近臥室或生活區。

巢脾貯藏前，要用起刮刀刮淨巢框上面的蜂膠、蠟瘤、下痢叼污跡及黴點等，然後分類貯存，箱外加以標註，以便以後選用。巢脾的分類，基本上可分爲蜜脾、粉脾和空脾三類，而空脾又可按色澤深淺分類。

清理好的巢脾，應保存在鼠類、蠟螟及蜜蜂不能到達的地方，最好藏在特製能密閉燻蒸的大櫥裏。大規模的蜂場，可以設立巢脾貯藏室。一般養蜂場有足夠的繼箱，即是保存巢脾現成的設備，但要預先徹底洗刷乾淨。蠟螟和巢蟲在10度以下就不動，所以有的地區，在冬季可暫免燻蒸。燻蒸巢脾的藥品，常用的有二硫化碳和硫磺粉兩種。

二硫化碳是一種無色、透明、略有特殊味的液體，密度1.263，常溫下易氣化。氣態下比空氣重、容易起火，有毒，使用時避免接近火源或吸入。燻蒸時可疊加六層繼箱，上下加蓋如非木質地板，應適當墊高防潮。每層繼箱排脾10框，頂上繼箱僅排8框，中央空出兩框位置，以便放藥。一切縫隙均需用紙條糊封。準備好後，人立上風處，用筒量好藥液，裝入杯、礴或廣口瓶，立即放人箱中，加蓋封嚴。如果一次成批燻蒸數箱，應從下風處開始，人漸往上風向退。此氣能殺死蠟螟的卵、幼蟲、蛹和成蟲。所以經一次徹底處理後，便能解決問題，除非刮後外面巢蟲重新侵入。二硫化碳的用量，按每立方米容積30毫升計算，即每個繼箱的用量，約合1.5毫升。考慮到不可能絕對密封，實際用量應酌加一倍左右。

如用硫磺粉燻蒸，應備一個有窗的空巢箱作爲底箱，上面疊加五層繼箱。第一層繼箱僅排列六框巢脾，分置兩側，空出中央的四框位置，以免燻蒸時巢脾熔化失火。其上四層各排脾10框底箱上放一塊瓦片，上加火炭數小塊。從窗口撒入硫磺粉後，就會立即燃燒，產生二氧化硫氣體，達到燻蒸殺蟲的目的。燃燒期間應通過窗口觀察，直至硫磺燒盡，炭火熄滅爲止。硫磺燻脾易發生失火事故，切勿大意。二氧化硫氣體具有強烈刺激性， 有毒，工作時應避免吸入。硫磺粉的用量，按每立方米50克計算每個繼箱約合2.5克。考慮到不可能絕對密封，實際用量也應酌加1倍左右。由於二氧化硫氣體燻脾，一般只能殺死蠟螟的成蟲和幼蟲，不能殺死卵和蛹，因此過10~15天要燻第二遍，再過15~20天后，要燻第三遍。這樣，以後羽化出來的蛾和新孵化出來的幼蟲，才能全部殺死。

燻蒸過的巢脾，應取出通風，通常經一晝夜，待完全無藥味後，才能使用。

病蜂用過的巢脾，要做好標記，單獨存放，並經嚴格消毒後，方能繼續使用。