南京郵電大學和南京中醫藥大學都位於高等教育基地之一的南京市，而且兩所學校都是2017年跨入世界一流學科建設高校門檻的高校，並且都是第一次成爲全國重點大學的高校。不過，兩所學校的區別也比較大，南京郵電大學是以通信爲主的高校，而南京中醫藥大學則是以國醫爲主的高校。

從兩所學校建校之初的規格來看，南京郵電大學更佔優勢。雖然南京郵電大學建校之初，僅僅是一所中專學校，但是他起碼是一所針對普通教育的中專；而南京中醫藥大學起步是針對成人教育的培訓機構而已。從這個角度來看，南京郵電大學起步解決勝過南京中醫藥大學一些。

不過從後期發展來看，南京郵電大學要慢於南京中醫藥大學。南京郵電大學升入“大學”是2005年；而南京中醫藥大學則是1995年晉級“大學”，兩所學校差距十年之久，由此可見南郵發展速度確實要慢一些。這主要是因爲改革開放之前，國內對中醫比較重視，而江蘇中醫基礎相對又比較強，所以南京中醫藥大學發展速度更快。也是這一時期，南京中醫藥大學建立了完整的中醫教研體系和實踐基地，爲後期的崛起和綻放奠定了堅實的基礎。

整體來看，南京中醫藥大學的實力要高於南京郵電大學一些。雖然南京郵電大學的規模要大於南京中醫藥大學，這一點確實是客觀事實。但是南京中醫藥大學在其擅長領域的知名度和影響力要遠高於南京郵電大學一些，畢竟通信是目前的熱門領域，全國各類高校競爭之地，南郵的實力根本就擠不進前十名，而南京中醫藥大學則位列全國前五，所以南京中醫藥大學更強，符合事實。