南京信息工程大學和南京曉莊學院兩所學校雖然都位於古都南京市，但是兩所學校的主力教研方向極爲不同。南京信息工程大學是以理工爲主的高校，主要在氣象方面實力強勁；而南京曉莊學院是以基礎文理爲主的高校，主要是爲了培養師範人才而創辦的學校。

提到南京曉莊學院，就必須提到陶行知。陶行知是中國人民救國會和中國民主同盟的主要領導人之一，他對農村發展和教育方面影響很大。陶行知和晏陽初是國內農村改革試驗代表人物，在這方面影響力很大，至今都是“三農”問題的一面旗幟。1926年陶行知發表了《中華教育改進社改造全國鄉村教育宣言》。1927年在南京北郊曉莊創辦了鄉村師範學校曉莊學校，同時創辦了全國第一家鄉村幼兒園，燕子磯幼稚園。

南京曉莊學院，事實上抗戰之後就停辦了，而目前的南京曉莊學院是1951年復建的學校，當時只是一所中專學校，面向主要是小學和學前教育的教師培養。不過後期辦學中坎坷較多，發展速度緩慢，一直到2000年才經合併院校的模式，升級爲一所“本科”高校。由此可見，其當時的實力確實很一般，建校基礎相對差很多。

南京信息工程大學是以南京大學氣象學院爲基礎組建而成，在大氣科學方面實力極強，尤其是合併了北京氣象學院之後，儼然成爲國內氣象領域的霸主，佔據絕對統治地位。整體來看，南京信息工程大學的實力完勝南京曉莊學院，畢竟南京信息工程大學目前已經脫離“雙非”高校，列入全國重點大學行列了。