并且不管是单独还是综合使用它们,都不能保证改善具有大量二级或三级结构的DNA扩增的有效性。正如此方案中描述的一样,如果一些增强剂同时使用,那么成功的机会就会增加。

此外,从商家可以购买含有添加剂的试剂盒。大多数试剂盒中除了其他未说明的添加剂,都默认含有甜菜碱添加剂。

●改变PCR循环条件。如果联合了降落PCR、热启动PCR及添加剂混合物都不能改善高GC模板的扩增,那么改变循环条件可能会解决这个问题。

例如,Frey 等(2008)描述了一种联合使用缓慢的升温速率(2.5"C/s) 和缓慢的冷却速率(1.5"C/s) 的方法来处理复性温度。“缓慢降落”PCR技术的一一个基本组分是包含在反应混合物中的7-脱氮-2'脱氧鸟苷。

在以下的方案中,使用了4种添加剂混合物一甜菜碱、 二硫苏糖醇(DTT)、 二甲基.亚砜(DMSO)及牛血清白蛋白(BSA),该方案改编自Ralser 等(2006)出版的关于使用Taq DNA聚合酶方法。

当使用添加剂混合液时,要优化反应中模板DNA的量和Mg2 *浓度。有报道指出,高浓度的模板DNA会抑制高GC序列的扩增(Ralser et al. 2006)。

“多重PCR”是指同一PCR中用N对引物同时扩增N个靶序列,N>1。作为从人类基因组DNA中筛选Duchenne型肌营养不良症(Chamberlinetal.1988)不同突变位点的一种有效方法,多重PCR现已被用于各种用途。

相关文章