與現代人的早期雜交導致後期尼安德特人體內Y染色體被替換 丹尼索瓦人則未被置換(Natural History Museum)

(神祕的地球uux.cn報道)據EurekAlert!:在最早一批全面分析人類兩個最近親屬(即丹尼索瓦人和尼安德特人)Y染色體的一項研究中,研究人員的報告與先前研究所提出的觀點一致,即古老人類與現代人類間的早期基因流動事件導致了古尼安德特人的Y染色體最終被滲入的智人Y染色體替換。丹尼索瓦人的Y染色體則未被智人的Y染色體置換。

Mikkel Heide Schierup在相關的《視角》中寫道:“在[這一]新研究之前…考古學家僅有爲數有限的2個尼安德特人的Y染色體數據,但有關這兩種人相遇早期所發生的Y染色體交換的信息則闕如。”越來越多的關於尼安德特人、丹尼索瓦人和智人的古DNA研究提示,它們有着互相交纏的演進和種羣歷史,其中包括早期現代人和古人類之間發生的幾次人種混合事件。然而,來自古時樣本的細胞核DNA和線粒體DNA序列(mtDNA)揭示了這3組人中很難進行解釋的系統發育差異。

例如,常染色體基因組顯示,尼安德特人和丹尼索瓦人是在距今55萬多年前與現代人分開的姊妹人羣。然而,除最早的尼安德特人mtDNA樣本外,其它所有樣本的mtDNA與現代人樣本的相似性都遠遠大於與丹尼索瓦人的相似性。這些研究提示,尼安德特人原先攜帶的是一種丹尼索瓦人樣的mtDNA,但後來通過與早期現代人雜交而被完全取代,時間可能在35萬年至15萬年前之間。雖然遺傳自父系的Y染色體的基因組數據會有助於解決令人困惑的基因流動,但迄今爲止,在研究過的男性尼安德特人和丹尼索瓦人遺骸中幾乎沒有保存完好的Y染色體DNA。

爲了彌合數據中的這一缺口,Martin Petr和同事用了一種基於靶向捕獲的DNA測序方法,旨在從保存不佳的3個尼安德特人男性和2個丹尼索瓦人男性的遺骸中富集和提取Y染色體序列。Petr等人發現,像遺傳自母系的mtDNA一樣,現代人和尼安德特人的Y染色體彼此之間的關係要近於和丹尼索瓦人的關係;這一發現支持這樣的觀點,即早期現代人與尼安德特人的種間雜交以及隨後的選擇導致了後期尼安德特人體內的更爲古老的丹尼索瓦人樣的基因物質被完全替換。

相關報道:研究揭示尼安德特人基因滲入的本質

(神祕的地球uux.cn報道)據小柯機器人:前段時間,冰島大學Kari Stefansson、丹麥奧爾胡斯大學Mikkel Heide Schierup和Laurits Skov小組合作,通過研究27,566個冰島人基因組揭示了尼安德特人基因滲入的本質。這一研究成果在線發表在2020年4月22日的《自然》上。

研究人員通過對來自27,566個冰島人的全階段全基因組序列中檢測到的1,440萬個假定古染色體片段的研究,檢測了尼安德特人基因滲入的影響;這些數據對應範圍爲56,388–112,709獨特古染色體片段,覆蓋了可調用基因組的38.0–48.2%。

基於與已知古基因組的相似性,研究人員將84.5%的片段與阿爾泰山脈或迪亞尼安德特人來源的基因相匹配,將3.3%的片段與丹尼索瓦人相匹配,未知來源的片段佔12.2%。

研究發現,冰島人有比預期更多的丹尼索瓦人樣基因碎片。丹尼索瓦人基因流可以最好地解釋這一點,它可以滲入尼安德特人的祖先,也可以直接流入人類。個體片段與同形非片段個體的內部配對比較顯示,儘管在人類和尼安德特人世系分離的50萬年中,雖然總體突變率相似,但相對頻率不同突變類型可能是由於男性和女性世代間隔不同造成的。

最後,研究人員評估了271個表型,報告了5個由古老片段變體驅動的關聯,並揭示大多數先前報道的關聯可以由非古老變體解釋。

研究人員表示,人類進化史隨着不同羣體的交融而豐富。除非洲之外的大多數人中約有2%的基因組是與尼安德特人基因的混合物,而尼安德特人的歷史發生在5萬至6萬年前。

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