近日，國際知名期刊Molecular Plant在線發表了來自雲南農業大學董揚教授課題組題爲“VitisGDB： The Multifunctional Database for Grapevine Breeding and Genetics”的研究論文（DOI：https：//doi.org/10.1016/j.molp.2020.05.002），標誌着我國在葡萄屬植物功能基因組學數據庫建設方面取得重要進展。該成果爲植物學家開展葡萄屬植物比較基因組學分析與葡萄遺傳育種提供了有力的在線分析工具。

葡萄是世界上最古老的果樹樹種之一，葡萄（Vitis vinifera ssp.vinifera）是葡萄屬中栽培最多的水果作物，該屬還含有約60種可育的野生種。在世界溫帶地區的原生棲息地中，北美約有28種野生葡萄品種，東亞約有30種野生葡萄種類。儘管葡萄栽培在人類歷史中具有重要的文化意涵及經濟價值，但大規模基因組遺傳變異數據的缺乏導致無法解析其馴化傳播歷史，也嚴重阻礙了葡萄的性狀改良。

隨着全球越來越多葡萄屬植物基因組的陸續解析，及相關重測序、轉錄調控等高通量數據的積累，研究者迫切需要一個能夠整合基因組、遺傳變異數據、轉錄組和表型組等多層次數據的比較工具，對葡萄屬的特定生物學特徵或基因家族的基因序列、結構等進行比較分析。爲此，董揚教授和盛軍教授、中科院植物研究所李紹華教授合作，共同構建了首個葡萄屬植物基因組學網站-VitisGDB（http：//vitisgdb.ynau.edu.cn/）。截至目前，VitisGDB共收錄了葡萄屬7個物種共22個基因組組裝結果；收錄並處理了包括1641個重測序數據以及相應的表型信息；預測鑑定出9395萬個單核苷酸變異位點（SNP）以及9.7萬個基因共線性關係。通過整合多種可視化組件與基因組在線比較工具，該數據庫將不同類型的數據有機整合到了一起，爲用戶提供了友好的數據檢索、下載和在線分析服務。論文在同行評議中，國際著名葡萄研究工作者給予極其高度的評價，認爲該數據庫是葡萄遺傳資源領域類目前最全面和易用的數據庫。該數據的上線，是我國葡萄遺傳資源的首個原創性數據庫，爲葡萄這種“一帶一路”典型作物的協同研究提供了重要的工具。