1949年遼瀋戰役結束後，四野解放軍在林彪的指揮下，揮師南下，進行了平津戰役，北平和平解放，四野再次接到命令，要消滅白崇禧集團30萬人，由此，四野再次南下，在這個時刻，陳賡的第四兵團，在中央軍委的命令下，被劃分給林彪指揮。

抗戰時期，陳賡就是劉鄧麾下大將，任386旅旅長，到了抗戰勝利時，陳賡成爲了劉鄧大軍麾下的四縱司令，後來，四縱和九縱一同被整編爲第四兵團，陳賡時任司令，由此，陳賡兵團正式形成，麾下下轄13軍、14軍和15軍，共10萬餘人。

陳賡時任司令，副司令是郭天民，當時中央軍委下令，要他們屬於林彪指揮時，兩人並沒有什麼怨氣，陳賡提議說，四野的老底子，都是中央蘇區的紅軍，而我們則是鄂豫皖蘇區的紅軍，考慮諸多原因，我們的部隊應該喊四野的部隊老大哥，郭天民對此表示贊同。

陳賡與林彪，早在1927年南昌起義時，就已經熟識，當時陳賡爲營長，林彪爲連長，在戰鬥中，林彪所在的連正打仗時，由於損失慘重，林彪想要離開，後來在陳賡的督促下，林彪才重新回到戰場，如今兩人的身份互換，林彪成爲了陳賡的上司。

陳賡兵團剛被劃分給林彪指揮，兩人就發生了衝突，當時林彪遠在鄭州，陳賡率部在江西，有一天，林彪派來一個聯絡副官，通知陳賡，林總此後指揮要到師，也就是說，這是“越級指揮”

陳賡對此不理解，也不能接受，越級指揮到師，那還要軍長幹什麼？陳賡就在這位聯絡副官給林彪的回電中稱：我們各師電臺少，不宜都溝通聯絡。

7月，林彪下令，要在湖南醴陵、衡陽一帶，與白崇禧主力部隊決戰，陳賡當時在南京開會，副司令郭天民與其麾下的軍長接到命令後，一致認爲，當時正是夏日，部隊紛紛減員，如果再長途跋涉打疲勞戰，並不合適，林彪是司令員總指揮，軍長雖然有意見，但是無論如何都不能戰場抗命，這是鐵令。

陳賡回來後，直接向軍委毛主席發電，反駁林彪的作戰計劃，並且說出不合適的地方，這份電報又分別呈送二野指揮部，林彪等人，幾天後，毛主席回電：陳賡做得對，白崇禧本錢小，極機靈，非萬不得已決不和我作戰，因此，對白作戰，應採取遠距離包圍迂迴方法，以掌握主動。

這是兩人第一次衝突，毛主席支持了陳賡，第二次衝突，是在新中國成立後，當時國民黨政權在廣州，他們準備難逃，林彪再次給陳賡下令：令四兵團後尾主力原地停止待命，先頭追敵部隊如未抓住敵人，並無把握喫掉敵人時也都現地停止，準備由曲江、英德地區直向西平行入桂，以達成協同四野於湘桂地區解決桂白(崇禧)問題。

林彪這份軍事計劃交給毛主席後，毛主席給予了支持，並且發電給陳賡，要他們按計劃行事，陳賡接到命令，找來了其他的兵團負責人，再次商議此事。

經過討論，陳賡認爲林彪的作戰計劃有變化，因而他再次給毛主席發電，指出了不足之處，毛主席看到後，並沒有生氣，反而是對陳賡提出了讚揚，並且回電接受陳賡提出的作戰計劃。

10月13日，陳賡督促所部，全部向廣州進發，毛主席來電，如果發現廣州一帶國民黨部隊向廣西逃竄時，陳賡兵團要片刻不停息的追逐，可是到了15日，林彪卻給陳賡發電，要他們休整，不要再追敵。

陳賡認爲林彪的計劃不符合毛主席的想法，就沒有遵守他的命令，反而令各部繼續追敵，毛主席否決了林彪的電報，要陳賡繼續追敵，陳賡所部事後取得巨大勝利，林彪發來賀電：祝賀第四兵團在恩平、陽春、陽江戰鬥中取得的勝利。

此後，在雷州半島一戰，林彪指揮失誤，陳賡再次提出反對建議，毛主席發電：同意陳賡同志建議，在陳賡的指揮下，第四兵團再次打了勝仗，殲滅敵人華中長官公署及所屬部隊12萬餘人，繳獲汽車400餘輛，野炮42門。

不過也有遺憾的一點，當時15軍正準備追擊剩下敵人時，林彪下令要15軍於當地剿匪，由此，剿匪4000餘人，卻是放跑了敵人1萬多人。

我們在今天來看，陳賡與林彪之間的軍事爭議，並不是參差着個人感情的，當時陳賡是在一線指揮，而林彪則是坐鎮後方，我們都知道，戰場上變化是很快的，時不我待，因而把握戰場上瞬息變化的機會，是一個優秀指戰員，必備的能力。

陳賡與林彪幾次衝突，原因都是如此，陳賡想的是更加具體地進行最後的戰爭結果，而林彪則是靠在後方指揮，由此，兩人有衝突，也是必然的。