據亞美尼亞新聞網11月19日報道，在亞美尼亞輸掉了納卡衝突之後，兩國簽署了不平等的停火協議，帕希尼揚代表亞美尼亞放棄了納卡大部分領土的所有權，還承諾從當地撤走亞美尼亞族居民。帕希尼揚在戰敗之後辯解稱，當時的戰局已經壞到了極點，亞美尼亞軍方也承認打不下去了，再打的話部署在納卡的2萬多大軍都會全軍覆沒，因此簽署這份協議也是無奈之舉，無論換成是誰上臺都沒有反敗爲勝的希望，然而他的蒼白辯護卻遭到了俄方的反駁，克林姆林宮透露，亞美尼亞本有着體面結束戰爭的機會，但是帕希尼揚當時拒絕俄軍干涉，導致戰局一發不可收拾。

根據兩國達成的協議，在停火之後將交換死者的遺體和戰俘，亞美尼亞方面聲稱至今仍有幾百名士兵“活不見人死不見屍”，要求阿塞拜疆方面給予協助，但是外界普遍認爲，鑑於在之前衝突中阿塞拜疆軍隊屢次曝光的虐殺戰俘醜聞，這些失蹤的士兵已經凶多吉少。果不其然，日前網絡上曝光了阿塞拜疆軍人屠殺傷員的視頻，視頻中顯示阿軍士兵在打掃戰場時對傷員挨個補槍不留活口，這種停戰之後還不“收刀”的行爲也引起了亞美尼亞方面的不滿，尤其是大批戰死士兵的家屬，更是流淚控訴對手的暴行，要求當局給出一個說法。

從阿軍士兵流出的視頻來看，阿塞拜疆一隊士兵在打掃戰場時，發現了受傷的亞美尼亞士兵，但是阿軍卻沒有對其進行救治，帶隊的軍官直接開槍將傷員打死，而一旁的其他的阿軍士兵則是起鬨歡呼，甚至還挨個補槍，對這名可憐的亞美尼亞士兵連開了20多槍，場面可以說是慘不忍睹。據報道，雖然阿塞拜疆方面一直聲稱所謂的虐殺戰俘行爲全是對手散播的假消息，但是越來越多的證據表明這不是空穴來風，並且阿軍方下令嚴禁將類似視頻和照片上傳網絡，就這樣還不斷有醜聞曝光，這說明目前曝光的阿軍戰爭罪行可能只不過是冰山一角。

對於阿塞拜疆方面曝光的戰爭醜聞，亞美尼亞一直呼籲國際社會給予干涉和阻止，但是由於各種原因，美國等之前力挺亞美尼亞的西方國家都拒絕干涉，這使得亞美尼亞方面孤掌難鳴，最後還是傳統盟友俄羅斯出手之後才保留了一點顏面，沒有丟掉納卡的全部地盤，而由於亞美尼亞一敗塗地，追究對手的戰爭罪行也幾乎是不可能之事了。