優化升級 | 博奧晶典人類環狀RNA芯片V2——RNA界的雷神之錘

摘要：博奧晶典人類環狀RNA芯片V2——博奧生物旗下北京博奧晶典生物技術有限公司自主研發設計的一款circRNA芯片，2019年4月，爲了方便研究者高效地篩選有效位點，博奧晶典針對此款芯片的位點註釋信息進行了全新的優化升級，利用主流circbase數據庫、deepbase數據庫結合經典文獻進行位點整合及註釋，在後續的實驗結果中可提供豐富的circRNA數據信息，完善的註釋內容，進一步提高circRNA鑑定的準確率，爲各位學者英雄進行後續研究提供便捷。研究者通過circRNA芯片鑑定胃癌（GC）相關的circRNA，發現circ-KIAA1244在胃癌患者的組織、血漿及細胞中均明顯低表達。

環狀RNA（circRNA，circular RNA）是RNA領域中的“雷神之錘”，它通過直接調控mRNA，或者通過ceRNA等多種機制在生長發育、疾病發生中發揮着重要的調控作用，因而受到各位學者英雄們追捧。但想舉起此錘，卻需要具有一定資質（if he be worthy）。

今天小編就和大家分享下

舉起“雷神之錘”的祕密所在

博奧晶典全新優化升級的circRNA芯片

博奧晶典人類環狀RNA芯片V2——博奧生物旗下北京博奧晶典生物技術有限公司自主研發設計的一款circRNA芯片，2019年4月，爲了方便研究者高效地篩選有效位點，博奧晶典針對此款芯片的位點註釋信息進行了全新的優化升級，利用主流circbase數據庫、deepbase數據庫結合經典文獻進行位點整合及註釋，在後續的實驗結果中可提供豐富的circRNA數據信息，完善的註釋內容，進一步提高circRNA鑑定的準確率，爲各位學者英雄進行後續研究提供便捷。

目前博奧晶典已支持多位老師利用該款circRNA芯片成功的舉起了“雷神之錘”，下面請欣賞他們的成功思路。

Part 1

利用circRNA芯片發現胃癌診斷的

生物標誌物

Molecular Cancer, 2018, 17: 137.

IF: 7.776

❖ 關鍵詞：circRNA、微陣列芯片、胃癌、biomarker、外泌體、血漿

❖樣本類型：血漿

❖ 樣本數量：10例胃癌患者、5例正常人

❖ 服務產品：本文中使用的circRNA芯片由北京博奧晶典生物技術有限公司提供技術服務

研究者通過circRNA芯片鑑定胃癌（GC）相關的circRNA，發現circ-KIAA1244在胃癌患者的組織、血漿及細胞中均明顯低表達。進一步的臨牀數據分析發現低表達的circ-KIAA1244與分級、淋巴轉移呈負相關，患者的生存期較短。同時本研究發現在血漿外泌體中也能鑑定到circ-KIAA1244，與血漿中的circ-KIAA1244表達量相比無明顯差異，結果表明circ-KIAA1244可以作爲診斷胃癌的biomaker。

圖1 circ-KIAA1244結構示意圖

圖2 circ-KIAA1244推論模式圖

Part 2

CircPSMC3通過競爭性結合miR-296-5p

抑制胃癌的增殖和轉移

Molecular Cancer, 2019, 18: 25.

IF: 7.776

❖ 關鍵詞：胃癌、CircPSMC3、miR-296-5p、PTEN

❖樣本類型：血漿

❖樣本數量：10例胃癌患者、5例正常人

❖ 服務產品：本文中使用的circRNA芯片由北京博奧晶典生物技術有限公司提供技術服務

研究者通過circRNA芯片鑑定胃癌（GC）相關的circRNA，發現CircPSMC3在胃癌患者的組織、血漿及細胞中均明顯低表達，與分級及生存期相關。通過熒光素酶報告實驗、RNA pull down及熒光原位雜交檢測circPSMC3與miR-296-5p的相互作用，利用過表達、基因敲除及轉染等實驗研究circPSMC3的功能，研究發現過表達circPSMC3和miR-296-5p抑制劑可以抑制胃癌細胞在體內和體外的發生，而同時轉染circPSMC3和miRNA-296-5p可以抵消這種作用，更爲重要的發現是circPSMC3可以作爲miR-296-5p的海綿，調控PTEN的表達，進一步抑制胃癌細胞的腫瘤發生。

本研究結果表明circPSMC3可作爲診斷胃癌的biomaker，同時通過結合miRNA-296-5p調控PTEN基因進而影響胃癌的形成，爲胃癌的治療提供了新的思路。

圖3 circPSMC3/miR-296-5p/PTEN作用機理示意圖

參考文獻：

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Tang Weiwei,Fu Kai,Sun Handong et al. CircRNA microarray profiling identifies a novel circulating biomarker for detection of gastric cancer.[J].Mol. Cancer, 2018, 17: 137.

Rong Dawei,Lu Chen,Zhang Betty et al. CircPSMC3 suppresses the proliferation and metastasis of gastric cancer by acting as a competitive endogenous RNA through sponging miR-296-5p.[J] .Mol. Cancer, 2019, 18: 25.

部分支持發表文獻：

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Chen S , Zhang L , Su Y , et al. Screening potential biomarkers for colorectal cancer based on circular RNA chips[J]. Oncology Reports, 2018, 39(6):2499-2512.

Ning B , Eming P , Xingsheng Q , et al. circFBLIM1 act as a ceRNA to promote hepatocellular cancer progression by sponging miR-346[J]. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, 2018, 37(1):172.

Qian Z , Liu H , Li M , et al. Potential Diagnostic Power of Blood Circular RNA Expression in Active Pulmonary Tuberculosis[J]. EBioMedicine, 2017, 27(C):18-26.

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Dang Y , Ouyang X , Zhang F , et al. Circular RNAs expression profiles in human gastric cancer[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1):9060.

Cao S , Wei D , Li X , et al. Novel circular RNA expression profiles reflect progression of patients with hypopharyngeal squamous cell carcinoma[J]. Oncotarget, 2017, 8(28).

Zhao Z , Li X , Gao C , et al. Peripheral blood circular RNA hsa_circ_0124644 can be used as a diagnostic biomarker of coronary artery disease[J]. Scientific Reports, 2017, 7:39918.

Zhao Z , Li X , Jian D , et al. Hsa_circ_0054633 in peripheral blood can be used as a diagnostic biomarker of pre-diabetes and type 2 diabetes mellitus[J]. Acta Diabetologica, 2017, 54(3):237-245.

博奧晶典ncRNA檢測平臺介紹

博奧晶典自2006年開始提供ncRNA檢測服務以來，目前已爲超過200家單位提供了科研服務，ncRNA檢測平臺支持發表文章250餘篇，影響因子超過1000分；目前博奧晶典可提供ncRNA檢測測序和芯片兩種平臺。博奧晶典科研服務事業部擁有經驗豐富的專業技術團隊，一直以顧客爲中心，以堅持科技領先、服務完善、注重細節、質量穩定爲基礎，提供創新、完善的整體解決方案。