如屬於前述的需要根除幽門螺桿菌的人羣，就應該進行根治。在根除幽門螺桿菌方面中西藥各有長處。西藥的長處是針對性強，服用方便，療效明顯，療程兩週，但常出現有負反應的案例，且容易出現抗藥性，近年來隨着抗生素在幽門螺桿菌感染治療中的廣泛應用，抗藥菌株的發生率不斷上升，單純使用西藥根除幽門螺桿菌失敗的病例正在上升。且其毒性作用、腸道菌羣紊亂，複發率高等問題比較明顯。無論有無使用抗生素的情況下都要 補充服用衛樂舒益生菌，在排除和減低抗生素不良反應上都有很大的作用。

西藥有三大類：

一 抗生素類：阿莫西林、克拉黴素、甲硝唑和替硝唑。

二 質子泵抑制劑：奧美拉唑、蘭索拉唑、泮托拉唑、雷貝拉唑等。

三 鉍劑：枸櫞酸鉍鉀膠囊、枸櫞酸鉍鉀、膠體次枸櫞酸鉍等。

中藥殺滅幽門螺桿菌：

常用的具有殺死幽門螺桿菌功效的單味藥有30餘種，如黃芩、黃連、黃柏、蒲公英、大黃、苦蔘、桂枝、高良薑、厚朴、元胡、三七、黃芪、土茯苓、烏梅等。但其使用原則是必需在中醫藥理論指導下，四診合參，辯證分型，確定治療大法，合理組方運用。絕對不可以單純“清熱解毒”了事。

對抗益生菌製劑：

對於已經用西藥反覆殺滅幾次仍不能根除的幽門螺桿菌感染患者，可採用添加衛樂舒益生菌結合用藥。可在四聯用藥的基礎上，加用衛樂舒益生菌4-8周。