准噶尔汗国(西里尔蒙文:Зүүнгарын хаант улс;藏文:ཇུན་གར།;维吾尔语:جوڭغار):是准噶尔部(卫拉特蒙古的一支)的首领噶尔丹1676年打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗之后、把松散的联盟体制步步改变为集权的政权体制、把准噶尔首领的台吉地位上升为汗王地位、于1678年正式建立的一个汗国。因为1635年卫拉特盟主固始汗遣使归顺后金(清朝)、及1646年卫拉特各部首领联名归顺清朝，所以它也改变了卫拉特与清朝的主从关系

1678年，噶尔丹出兵南疆，占领叶尔羌汗国。1688年，噶尔丹突然率兵越过杭爱山大举进攻土谢图汗，迫使喀尔喀蒙古诸部南迁。1690年6月，噶尔丹又向漠北喀尔喀蒙古进攻，玄烨组织左右两路大军亲征，噶尔丹溃逃

准噶尔汗国示意图

1697年噶尔丹服毒自杀，子策妄阿拉布坦继任准噶尔部台吉，准噶尔部又逐渐强大起来，与清朝再次发生冲突。1716年，准噶尔部出兵西藏，占领拉萨。1718年，清朝由青海出兵入藏，全军覆没。1720年，清朝第二次出兵，赶走准噶尔军

1755年，清朝乾隆皇帝趁准噶尔内乱之机出兵进占伊犁、击溃达瓦齐军，并于1757年平定阿睦尔撒纳的叛乱，1760年冬天，准噶尔汗国灭亡。

准噶尔被灭亡后，土地分别被清朝和沙皇俄罗斯占领。清朝所得部分准噶尔部蒙古人被杀光。