準噶爾汗國(西里爾蒙文:Зүүнгарын хаант улс;藏文:ཇུན་གར།;維吾爾語:جوڭغار):是準噶爾部(衛拉特蒙古的一支)的首領噶爾丹1676年打敗衛拉特盟主鄂齊爾圖汗之後、把鬆散的聯盟體制步步改變爲集權的政權體制、把準噶爾首領的臺吉地位上升爲汗王地位、於1678年正式建立的一個汗國。因爲1635年衛拉特盟主固始汗遣使歸順後金(清朝)、及1646年衛拉特各部首領聯名歸順清朝，所以它也改變了衛拉特與清朝的主從關係

1678年，噶爾丹出兵南疆，佔領葉爾羌汗國。1688年，噶爾丹突然率兵越過杭愛山大舉進攻土謝圖汗，迫使喀爾喀蒙古諸部南遷。1690年6月，噶爾丹又向漠北喀爾喀蒙古進攻，玄燁組織左右兩路大軍親征，噶爾丹潰逃

準噶爾汗國示意圖

1697年噶爾丹服毒自殺，子策妄阿拉布坦繼任準噶爾部臺吉，準噶爾部又逐漸強大起來，與清朝再次發生衝突。1716年，準噶爾部出兵西藏，佔領拉薩。1718年，清朝由青海出兵入藏，全軍覆沒。1720年，清朝第二次出兵，趕走準噶爾軍

1755年，清朝乾隆皇帝趁準噶爾內亂之機出兵進佔伊犁、擊潰達瓦齊軍，並於1757年平定阿睦爾撒納的叛亂，1760年冬天，準噶爾汗國滅亡。

準噶爾被滅亡後，土地分別被清朝和沙皇俄羅斯佔領。清朝所得部分準噶爾部蒙古人被殺光。