2010年，退役後的約爾迪·克魯伊夫並沒有跟隨父親的腳步返回阿賈克斯，小克魯伊夫選擇以體育主管的身份加盟了塞浦路斯的拉納卡AEK足球俱樂部，合同爲期三年。上任後的小克魯伊夫邀請了荷蘭人卡能來擔任球隊的主教練。第一個賽季，拉納卡AEK以塞浦路斯足球聯賽第四名的成績獲得了2011-2012賽季的歐羅巴聯賽的參賽資格。而在2011-2012賽季的歐羅巴聯賽資格賽中，拉納卡AEK隊爆冷淘汰挪超勁旅羅森博格足球俱樂部，晉級小組賽階段，這也是塞浦路斯足球歷史上第一支殺入歐羅巴聯賽正賽階段的球隊。

2012年4月，特拉維夫馬卡比老闆米切爾·高德哈爾通過支付給拉納卡AEK隊補償金的方式，把小克魯伊夫給挖了過去。小克魯伊夫到任後的第一件事就是把他在效力巴薩時的隊友奧斯卡·加西亞請來擔任球隊的主教練。2012年時，球隊已經有足足9年時間沒有拿到過國內聯賽的冠軍，在小克魯伊夫和加西亞這對黃金搭檔的帶領下，特拉維夫馬卡比隊以領先第二名13分的優勢，時隔10年再度獲得了以色列足球超級聯賽的冠軍。

2013-2014賽季，由於功勳主帥奧斯卡·加西亞在賽季末離開了球隊，小克魯伊夫請來了前葡萄牙球星保羅·索薩擔任球隊的新任主帥。人員變化沒有影響特拉維夫馬卡比隊在以色列聯賽的統治力，球隊仍以16分的巨大優勢成功衛冕。而且在這個賽季，球隊在歐羅巴聯賽中也有所作爲，晉級32強。

2014-2015賽季，對於特拉維夫馬卡比隊而言是一個很艱難的賽季。首先，就是球隊主帥保羅·索薩離開了球隊。其次，由於歐足聯的禁令，特拉維夫馬卡比隊不能在歐冠聯賽和歐羅巴聯賽中在以色列本土比賽，這也意味着球隊在歐冠和歐聯的主場比賽必須移到中立球場。而在主教練的選拔上，在賽季開始前，小克魯伊夫才任命貝尼特斯在利物浦時期的助手阿耶斯塔蘭成爲球隊的新任主帥。不過這個賽季，球隊卻獲得以色列國內三冠王。

2015年4月，小克魯伊夫拒絕了來自英冠球隊和德甲球隊的報價，選擇與特拉維夫馬卡比隊繼續延長兩年的合同。2015-2016賽季，約爾迪·克魯伊夫任命斯拉維薩·約卡諾維奇成爲球隊的新任主教練。在約卡諾維奇的帶領下，球隊時隔11年再度殺入歐冠小組賽正賽階段的比賽。2016年夏天，在約卡諾維奇受到富勒姆隊的邀請後，小克魯伊夫立刻找到了彼得·博斯作爲球隊帥位的接任者，在博斯的任內，特拉維夫馬卡比隊19戰12勝7平保持不敗。

上賽季，小克魯伊夫出任了球隊主教練，結果球隊常規賽第三，爭冠賽第二，未能奪冠。賽季結束後他也離開了以色列。

管理有方，執教經驗欠缺

以色列媒體報道，約爾迪·克魯伊夫的到來使得特拉維夫馬卡比隊改變了許多。以前球隊的訓練一直對球迷和媒體開放，球場周圍總是一片嘈雜，小克魯伊夫不顧球迷的罵聲，啓用了封閉訓練政策，讓球場“安靜”了下來。此外，他也對球員們採用了嚴密的“監控”，他在每一場比賽，每一次訓練中，給每位球員都裝上了GPS跟蹤系統來檢測運動情況，“這樣他們就沒法偷懶了。”小克魯伊夫說。

不僅如此，小克魯伊夫的功夫也做到了球員的“嘴”上。他要求球員都必須在俱樂部裏用餐，以免受到不健康食物的誘惑。球隊每日的菜譜都經過精心設計，甚至包括增添的蔬菜沙拉也是爲了讓球員們控制每日的熱量攝入，以色列球員們因此逐漸明晰，管理口腹之慾也是一位職業球員的職責。

在選帥方面，小克魯伊夫堅持了自己的“歐化”道路，而他的眼光也十分獨到，小克魯伊夫會針對球隊的技戰術風格，選擇擅長控球戰術的主教練。不過媒體指出，小克魯伊夫最大的短板在於執教經驗。作爲體育主管，小克魯伊維特有着很不錯的工作經驗，甚至巴薩俱樂部都曾向他發出邀請。但作爲一名教練，他在這之前僅僅只有一年的執教經驗。重慶斯威此番選擇小克魯伊夫作爲主教練，不得不說是一種賭博式的行爲。

值得一提的是，在2016年接手重慶足球之後，重慶隊光在管理層的位置上，就有不少足壇名宿逗留過。先有姚夏、郭光琪、區楚良，後有宮磊，甚至還有“外援”亞當斯以及特魯西埃，不過這些管理層都未能在俱樂部長期任職，有的甚至不到半年時間就悄然離開。