作爲Samsung本年旗艦機款，Galaxy S21 Ultra不單擁有更全面攝影表現，同時也首度加入Note系列招牌的S Pen筆控功能。較早前有疑似原廠S Pen配件跟專屬機套的CAD設計圖曝光，可看到揭蓋式機套內側加入S Pen筆插位。

由德國媒體流出一系列疑似S21 Ultra配件CAD機圖可以看到。這款加入S Pen筆插的機套，應爲型號Smart View Flip Cover系列的S Pen專屬版本。其採用揭蓋式設計，機面保留透明位供屏幕作Always On顯示，機身左方揭蓋內側位置，加入了能插入S Pen的筆插設計，方便收藏筆身及讓手機爲其作無線充電。

除了專屬機套外，外媒展示了S21 Ultra版本的S Pen筆身圖片，其外型跟去年推出的Tab S7系列配備的S Pen頗爲相近，據透露新版S Pen與Note 20配備的S Pen相近，主要分別爲未加入方便從機身筆槽拔出的彈弓位。

S21 Ultra版本S Pen將保留藍牙傳輸、螺陀儀跟速度感應器，方便作Air Command指令及手勢操作；有消息指其歐版獨立零售價將爲40歐元，同時亦頗有機會提供S Pen連專屬機套的同捆配件組合發售。