民國9年（1920）9月，駐夔北洋軍豫軍王安南部和鄂軍黎天才部與川軍範紹增部衝突，川軍敗退，豫、鄂軍洗劫夔城一空。

劉伯承時任廣州軍政府所屬四川陸軍第一軍第五師熊克武所部第二混成旅第一團團長，實際上以指揮名義統轄全旅。同年冬，劉率全旅東下，討伐駐夔的北洋軍。劉率軍至朱衣口前，即舍舟登岸，乘晨霧進攻。一路由三臺觀繞道長嶺岡，直插蓮花寺，居高臨下，攻打天主宮的鄂軍司令部；一路經白馬寺直通西坪，襲擊鮑公館的豫軍司令部。豫、鄂軍暈頭轉向，潰不成軍，逃至江邊，奪船東下。僅兩個多小時的戰鬥，豫、鄂軍即被趕走，繳槍三百餘支，彈藥二百多箱，收編百餘人。劉伯承率部入城，張貼布告。宣傳孫中山的革命主張，揭露北洋軍閥的罪行，免除苛捐雜稅，嚴禁盜竊。劉親自帶隊巡查，瞭解民情，檢查軍紀。一天，一名剛收編的豫軍排長在考棚街搶劫民財，強姦婦女。劉得知以後，便在天主宮召開羣衆大會，當衆將其處決。百姓交口稱讚。僅兩個多月，盜匪猖撅的奉節城，治安即大爲改觀。

民國11年（1922）四川一、二軍交戰。8月16日楊森所部二軍七、八千人敗退夔州，一軍第一路指揮劉伯承率部窮追不捨。楊軍欲憑南天門天險固守一時，以待鄂軍應援。命李樹勳率部千餘人，距城三十里憑險扼守，其一部擬經公平上攻雲陽。恰值雲陽民團追奉節王毅達部至白蠟山，楊軍誤以爲一軍迫至，慌忙撤退。時大雨傾盆，溪水陡漲，溺水死者甚衆，部隊進退艱難。楊軍大部尚駐城內，一部與一軍交戰於長嶺岡，忽大風，雷雨交作，楊軍潰敗，搶渡瀼水東逃。赴公平之部由白水池入頭溪鄉與大軍會合，退往鄂西。同時，吳佩孚援楊武器彈藥正運至夔，而楊軍大敗，押運官兵隨楊軍上浮橋渡瀼水逃命，時大風雨，浪高過頂，人多爭渡，浮橋沉水，死者甚衆。所運軍械，悉爲一軍所得。適孫傳芳援楊北軍一團已抵奉，楊森特設宴爲之洗塵。值天雨，劉伯承派兵一連輕裝來襲，以20名精壯，自城腳排水溝人城，擊潰守城士兵，大開城門，放部隊入城，與二軍沿街巷戰，一時槍聲大作，全城混亂。楊森以爲大軍追到，倉皇跑到江邊，奪得木筏一隻，渡江循小路至大溪乘小貨輪，隻身逃往宜昌，文件行李，丟失罄盡。二師師長唐式遵抓了一塊門板才逃脫性命。一時軍中無主，士兵紛紛向河邊爭渡，大小船隻一搶而光，落水溺死者無數。戰到午夜，一軍士兵喊話勸降，楊軍本是驚弓之鳥，又飢疲已極，無心再戰。紛紛繳械投降。待到天明，一軍大部隊趕到，楊軍方纔醒悟過來。此役繳獲槍支一萬餘隻，創造了兩三百人戰勝近萬敵軍的奇蹟。

劉伯承率軍駐防奉節，團部設禹王宮，後遷新公館。所部軍紀嚴明，愛護百姓，大力剿匪，整治社會秩序，深受百姓擁戴。