1921年，外蒙古爆发共产主义者革命。虽然外蒙古不属于苏联，但受到了斯大林时期苏联的强大影响。因此30年代苏联大清洗时期，斯大林军队屠杀了外蒙古3%到5%的人口，杀掉了大量僧侣，毁坏了约2000座修道院和寺庙。同时还有五万中华民国的侨民未留下一个活口。

大清洗开始，根登的阳奉阴违

1933年大清洗之初，斯大林授意根登效法苏联在党内抓“反革命集团”。

1934年以后，斯大林的指令与根登内心深处的宗教信仰不可调和，最终两人剑拔弩张。

斯大林多次催逼根登要在1937年前全面清除宗教阶层，暗示杀掉10万僧侣，这道命令触碰到根登的情感底线，但他不敢公开违抗，只能阳奉阴违。由于他的消极抵制，致使这一任务被延期两年。根登很快丧失了斯大林的宠信。

1937年底，根登被扣上“反革命罪和日本间谍罪”的帽子遭处决。之后的外蒙古，进入了乔巴山时代。

大清洗开始，乔巴山的配合

1937年8月应外蒙古政府之“邀请”，苏联增派野战军3万人进驻外蒙古，大清洗由此拉开序幕。

1937年9月10日，大清洗正式开始，当晚外蒙古人民革命党高层65名干部被捕，包括中央委员会成员、大呼拉尔成员、部长会议成员、军队高层全部将领。外蒙内务部在苏联专家教导下，对这65人实施“坐火椅、拔指甲、扯光头发”等酷刑，扒光衣服，严禁睡觉，不准吃饭，直到在伪造的“招供状”上签字为止；还被迫承认“反革命”，供出更多“同伙”名单。

大清洗第一场胜仗抓出了“根登—德米德反革命间谍集团”，根据他们的“口供”，内务部揪出了更多的人，军队旅以上有187名将领被捕，51个中央委员会成员有36个被枪决。有1000多名军人为了避免被杀，主动“承认”自己的“反革命罪”，最初只有几个人得到赦免，以后绝大部分仍被枪毙，不少人全家被杀，甚至包括孕妇。

同时针对宗教界的大清洗也展开了，规模更为庞大和血腥。指导大清洗的苏联总顾问格鲁伯奇克1938年8月向斯大林报告：“到7月20日，771座寺院已有615个变成废墟，8.5万名喇嘛仅留下17338人。”

内务部成员卢瓦桑萨姆丹1962年回忆，由于逮捕的僧侣太多，导致监狱拥挤不堪，每周会有一两次集体处决，每次用卡车一车车拉出去。

1939年末，乔巴山在笔记本里记下了这样一段工作总结：“到11月，共处决喇嘛20356人，其中高级喇嘛600名 ，中级喇嘛3174名，低级喇嘛13120名，摧毁797座寺庙；在1937年和1939年之间，逮捕了56938人，其中20396被处决，被逮捕的人中有17335人是喇嘛”。

另有外蒙境内的2.1万哈萨克斯坦人被消灭了2000人；140个塔塔尔人只剩下4个；来自中国内蒙的汉蒙两族人士几乎未留下一个活口。

后记

外蒙古大清洗确切的死亡人数目前尚无定论，遇难人数有从3.6万至10万人不等的版本。而外蒙古数百年所积累下的书籍、卷册、艺术品毁灭殆尽，寺庙的金银器皿全被苏联人搜刮而去。