明朝前期，蒙古与后金女真是世仇，满清政权的奠基者努尔哈赤为了缓和满蒙矛盾，开始采取与蒙古部落政治联姻的措施，逐步分化、收服蒙古各部。

他就先后迎娶科尔沁两个贝勒的女儿为妃。他的子女兄弟更是嫁往迎娶，热闹不已。

这些举措，对蒙古诸部产生了极大的吸引力，蒙古部落本来就是一盘散沙，很多部落相继投奔依附后金，这样，通过婚姻联系，不仅增强了后金的军事实力，也对敌对者林丹汗形成孤立。察哈尔首领林丹汗号称蒙古之主，是成吉思汗的嫡系子孙。

到了皇太极时期，就召集蒙古部落首领在沈阳立誓会盟，共举皇太极为盟主，联合出兵攻打察哈尔部。林丹汗因部属纷纷叛离，力量消弱，只得向西逃去，后在青海大草滩出天花而死。林丹大汗一死，蒙古诸部更是一盘散沙，被努尔哈赤与皇太极逐一收服。

接着皇太极为了宠络蒙古各部，又迎娶林丹汗的妻子窦土门福晋为衍庆宫淑妃，还得到元朝传国玉玺。皇太极的十五个后妃中，其中五个皆是蒙古族。其中就有孝庄太后，不但帮助后来的康熙获得了江山，还奠定了清朝的长治久安。

在蒙古族聚居地区实行盟旗制度。清朝给蒙古各部划定了牧区，规定不许越界放牧，各部不得互相攻伐。这一制度的实施，彻底禁锢了游牧民族逐水草而居的习性，将牧民限制在一个旗之内的狭小领地，彪悍的本性逐步驯化。

清代统治者深知蒙古人宠信喇嘛教，于是因势利导，大力发展喇嘛教格鲁派（黄教），削弱蒙古族“英勇尚武”的传统。

清廷大力鼓励蒙古兴建寺庙，规定家有两男以上者，必须有一人出家做喇嘛。这些寺庙，长期驻庙喇嘛多则2500人，少则亦有10余人。

喇嘛是不能娶妻生子的，发展喇嘛教使人口大量减少。喇嘛被免除兵役、徭役和赋税，刺激了更多平民出家为僧，大量劳动力云集各庙宇，念经修佛，反抗意识淡化，这些本来充满血性的蒙古勇士，全变成了每天念经的喇嘛，变得温顺无比。

大量劳力不婚不嫁，导致不正当的性行为增多，造成性病流行，瘟疫不断，死亡率提高，严重影响人口质量和数量。

清王朝利用通婚和喇嘛教，对蒙古人进行心理驯服，使曾经桀骜的天之骄子成为了清朝的百年顺民。

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