10x Genomics单细胞ATAC优惠第二弹 | 高级分析免费送

摘要：单细胞ATAC-seq数据与单细胞转录组数据进行相关性分析，绘制亚群相关性图和细胞类群预测图，可实现对细胞类型进一步的注释和定义。单细胞ATAC-seq高级分析免费送活动。

博奥晶典单细胞ATAC-seq优惠第一弹

活动反响热烈

12例样本优惠分分钟被秒杀

以下是上期活动参与名单

感谢各位老师的积极参与！

没有赶上第一弹优惠的老师不要桑心

第二弹优惠来了！

本期博奥晶典推出

单细胞ATAC-seq高级分析免费送活动

以期为您提供更加全面深入的数据分析服务

活动详情

活动时间：

2019年5月6日—2019年9月30日

活动内容：

单细胞ATAC-seq 10个项目高级分析免费送

（仅限人和小鼠2个物种）

活动细则：

1. 每个项目免费送一次博奥晶典单细胞ATAC-seq全部高级分析内容（10个名额，先到先得）；

2. 该优惠活动与单细胞ATAC-seq建库+测序5折优惠活动不可同时享有；

3. 2019年9月30日之前完成送样、签订合同并到款80%的老师可参与本次活动。

参与方式：

请联系当地销售或技术支持，或直接发送意向和联系方式到

[email protected]，届时我们会与您联系。

想必各位老师已经蠢蠢欲动了吧！

别着急小编先为大家展示下

单细胞ATAC-seq的高级数据分析内容及研究意义

高级数据分析展示

共可及性分析

共可及性分析可反映不同Peak峰之间的共可及性。连线越多，峰越高，代表共可及性越强。细胞处于不同的分化状态时，Peak峰之间的共可及性会有明显不同。因此可通过Peak峰共可及性图推测细胞的分化状态，判断细胞是否分化成熟。

图1 Peak峰共可及性图

拟时间序列分析

根据染色质可及性绘制亚群的拟时间序列图，可预测不同细胞之间的分化或者发育关系，推测未知细胞亚群的功能。

图2 拟时间序列图

与单细胞转录组数据联合分析

单细胞ATAC-seq数据与单细胞转录组数据进行相关性分析，绘制亚群相关性图和细胞类群预测图，可实现对细胞类型进一步的注释和定义。

图3 亚群相关性图（左）；细胞类群预测图（右）

转录因子与基因表达

单细胞ATAC-seq数据与单细胞转录组数据联合预测转录因子对调控基因的正向或负向调控机制。

图4 转录因子调控曲线图

与GWAS数据关联分析

单细胞ATAC-seq数据与GWAS数据关联分析，可挖掘更多与人类疾病相关的信息。

图5 亚群与疾病关联图（左）；

单细胞ATAC-seq数据与GWAS关联分析（右）

参考文献：

[1] Multiplex single-cell profiling of chromatin accessibility by combinatorial cellular indexing.Science. (2015)

[2] A Single-Cell Atlas of In Vivo Mammalian Chromatin Accessibility.Cell.(2018).

博奥晶典单细胞测序平台介绍

博奥生物旗下博奥晶典作为国内第一批引进10x Genomics平台的公司，已在国内开展上万级通量的单细胞转录组测序服务。目前已经完成了2000多个样品、100多种不同样品类型的服务，覆盖的物种和样品类型包括人和小鼠的肝脏、肺脏、皮肤、心脏、脑、肾脏、血液、卵巢、神经，以及鸡、斑马鱼、猪、水稻、拟南芥、油菜、白菜、橄榄等，是目前国内大规模单细胞测序经验丰富的公司。博奥晶典支持10x Genomics单细胞转录组测序的国内首篇科研论文发表在《PNAS》上，并且目前为止该平台国内最高分科研论文发表在国际干细胞领域顶级期刊《Cell Stem Cell》，斑马鱼造血干细胞研究最新发表在《Cell Reports》上。

博奥晶典于2018年9月与BD（中国）成立单细胞研究联合实验室，致力于大规模单细胞测序产品的开发和打磨，目前可开展如下单细胞测序产品的服务。