摘要：單細胞ATAC-seq數據與單細胞轉錄組數據進行相關性分析，繪製亞羣相關性圖和細胞類羣預測圖，可實現對細胞類型進一步的註釋和定義。單細胞ATAC-seq高級分析免費送活動。

博奧晶典單細胞ATAC-seq優惠第一彈

活動反響熱烈

12例樣本優惠分分鐘被秒殺

以下是上期活動參與名單

感謝各位老師的積極參與！

沒有趕上第一彈優惠的老師不要桑心

第二彈優惠來了！

本期博奧晶典推出

單細胞ATAC-seq高級分析免費送活動

以期爲您提供更加全面深入的數據分析服務

活動詳情

活動時間：

2019年5月6日—2019年9月30日

活動內容：

單細胞ATAC-seq 10個項目高級分析免費送

（僅限人和小鼠2個物種）

活動細則：

1. 每個項目免費送一次博奧晶典單細胞ATAC-seq全部高級分析內容（10個名額，先到先得）；

2. 該優惠活動與單細胞ATAC-seq建庫+測序5折優惠活動不可同時享有；

3. 2019年9月30日之前完成送樣、簽訂合同併到款80%的老師可參與本次活動。

參與方式：

請聯繫當地銷售或技術支持，或直接發送意向和聯繫方式到

[email protected]，屆時我們會與您聯繫。

想必各位老師已經蠢蠢欲動了吧！

彆着急小編先爲大家展示下

單細胞ATAC-seq的高級數據分析內容及研究意義

高級數據分析展示

共可及性分析

共可及性分析可反映不同Peak峯之間的共可及性。連線越多，峯越高，代表共可及性越強。細胞處於不同的分化狀態時，Peak峯之間的共可及性會有明顯不同。因此可通過Peak峯共可及性圖推測細胞的分化狀態，判斷細胞是否分化成熟。

圖1 Peak峯共可及性圖

擬時間序列分析

根據染色質可及性繪製亞羣的擬時間序列圖，可預測不同細胞之間的分化或者發育關係，推測未知細胞亞羣的功能。

圖2 擬時間序列圖

與單細胞轉錄組數據聯合分析

單細胞ATAC-seq數據與單細胞轉錄組數據進行相關性分析，繪製亞羣相關性圖和細胞類羣預測圖，可實現對細胞類型進一步的註釋和定義。

圖3 亞羣相關性圖（左）；細胞類羣預測圖（右）

轉錄因子與基因表達

單細胞ATAC-seq數據與單細胞轉錄組數據聯合預測轉錄因子對調控基因的正向或負向調控機制。

圖4 轉錄因子調控曲線圖

與GWAS數據關聯分析

單細胞ATAC-seq數據與GWAS數據關聯分析，可挖掘更多與人類疾病相關的信息。

圖5 亞羣與疾病關聯圖（左）；

單細胞ATAC-seq數據與GWAS關聯分析（右）

參考文獻：

[1] Multiplex single-cell profiling of chromatin accessibility by combinatorial cellular indexing.Science. (2015)

[2] A Single-Cell Atlas of In Vivo Mammalian Chromatin Accessibility.Cell.(2018).

博奧晶典單細胞測序平臺介紹

博奧生物旗下博奧晶典作爲國內第一批引進10x Genomics平臺的公司，已在國內開展上萬級通量的單細胞轉錄組測序服務。目前已經完成了2000多個樣品、100多種不同樣品類型的服務，覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經，以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等，是目前國內大規模單細胞測序經驗豐富的公司。博奧晶典支持10x Genomics單細胞轉錄組測序的國內首篇科研論文發表在《PNAS》上，並且目前爲止該平臺國內最高分科研論文發表在國際幹細胞領域頂級期刊《Cell Stem Cell》，斑馬魚造血幹細胞研究最新發表在《Cell Reports》上。

博奧晶典於2018年9月與BD（中國）成立單細胞研究聯合實驗室，致力於大規模單細胞測序產品的開發和打磨，目前可開展如下單細胞測序產品的服務。

稿件來源：博奧晶典

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