另外，可使用一-種鉗位均勻電場(CHEF)六邊形的陣列系統，其轉換時間爲1~ 150s/脈衝，以9V/cm，15C，持續20h ( Zimmer and Verrinder Gibbins 1997)。

1.加2g瓊脂糖到180mL dH2O中，旋轉混勻。在微波爐中加熱溶液4min。加入20mL5XTBE，再次旋轉混勻。將1% (m/V)瓊脂糖溶液倒入一個脈衝電場凝膠模子中，使其聚合。

2.在一個孔中插入2mm的低量程PFG DNA梯形標記凝膠。要確保沒有氣泡。

3.加入2L 0.5XTBE到凝膠盒子中，通過冷卻模塊循環使緩衝液冷卻到14C。

4.加10μL樣品到其他孔中。在CHEF-DR II (Bio-Rad 公司)系統中14'C，6V/cm運行，起始和最終的轉換時間爲5s和20s，120角， 持續16h。

5.從機器中移出凝膠，置於0.5mg/mL的溴化乙錠溶液中(10μuL 溴化乙錠儲備液加入200mL的dH2O中)。在搖牀上輕輕轉動1h。倒掉溶液，用200mL dH2O 洗滌凝膠1h。用數字成像系統爲凝膠拍照。

在兩步法中，將一個單獨的質粒導入攜帶BAC的細胞系中(見本章導言圖5-4和圖5-5)。穿梭載體pLD53.SCAB (或pLD53.SCAEB) (見本章導言圖5-5)攜帶recA基因和R6Kγ的起點，其複製需要π蛋白。

表達π蛋白的PIR2細胞常被用於載體的擴增和維持供體載體約15拷貝/細胞，在此宿主中該載體比較穩定。