汤氏所乘船名，为 Jesus，除汤氏外，选派赴中国之教徒，尚有二十一人，搭客及船员共六百十四人，活的鸡鸭等家禽，约一万只，于一六一八年四月十六日由里斯本出发。

汤氏等被安放于食物及行李间内，有如沙丁鱼一般，然在旅行途中训练不辍，由金尼阁训导，每日在海阔天空之船板上，温习旧业，礼拜二、五数学，礼拜三及礼拜六中文，此外另有天文小组，汤若望即在其中攻读，缘其院长曾引利玛窦之言："教徒中有天文学之技能，可以修正中国历书者，则声誉增加，入境容易，且得有安全及自由之保障。"

汤若望等最终决定继续前进，到一六一九年七月十五日，抵达葡属澳门，汤氏复从范礼安神父进修中文，范氏系在整肃中被逐出，而抵澳门者，在一六二二年（明天启二年）七月，汤氏仍蛰居澳门，值荷兰人来攻，葡人架炮于汤氏住屋上，击中荷人，荷人败走，澳门之围遂解。

同年季夏时，汤氏约同另外教徒三人，暗中进入中国境内，开始北上。后留其伴侣于杭州，汤独自随龙华民神父赴北京，龙亦系被迫害之教士，在杭匿居者，二人于一六二三年一月廿五日入北京，居住于靠近西南城门之一小屋内，亦即昔日利玛窦所下榻之处。

记得汤氏曾有以下描写："余是时系一青年，与高龄龙神父至北京后，犹忆龙神父会同另一神父，上书明熹宗'请求准予留住北京，为朝廷制造黄铜大炮'。"

其时驱逐神父之法令，尚未解除，上奏结果，亦杳无消息，但两神父，以所奏请未得圣旨为辞，仍继续留住北京，适此时政治幕后情形，将有重大改变，间接有利于传教士，缘发动一六一六年迫害传教士之首脑人物沈榷已经失宠，同时明朝军队受长城以北满洲军队攻击，遭受重大损失。

第一种因素，沈榷下台后，就换上曾经信教之徐光启及李之藻，又因第二种因素，徐李二人便有机会引进西洋人技术，以促起明朝皇帝了解武器之重要，他们催着将澳门的炮，赶紧运来，以抵抗满洲，并提议来华教徒，均充作顾问，炮果然运到了，但不幸有两尊炮炸裂，炸死旁观中国人数名，沈榷借此事件，再度攻击基督教，但教徒未被赶出北京并仍旧在各省传教。