漢代思想的建樹是多方面的，和神話有關的也是層出不窮。例如在漢代儒家思想體系董仲舒提出的天人感應、天命理論和神權政治；道教思想中的長生不老思想和神道理論；讖諱中和神話有關聯的神學唯心主義思想。

一、董仲舒的天命思想

董仲舒思想是以天人感應爲內容和特點的唯心主義目的論。天人關係是其哲學思想探討的基本問題。分析董仲舒的思想，首先要對他的“天論”進行分析。

董仲舒的主要著作中，有一系列的天命鬼神思想。董仲舒所講的天和神靈、道德、和自然有關。董仲舒很想把這三者完美地融合起來，統一在一起，但是他終究沒有很好的完成這一命題，因爲本身這三者就各有特性，分屬不同領域。

我們首先來看神靈之天。

王者必受命而後王。王者必改正翔，易服色，制禮樂，一統於天下，所以明易姓，非繼仁，通以己受之於天也。這些說法基本上是先秦以來傳統天命觀的沿襲，其範圍主要限於論述君權神授。當然董仲舒對天命思想也有創造與突破，這表現在兩個方面一方面提出“災異遣告”，另一方面，天命不僅指上帝的旨意也包括道德和衍生萬物的氣。因此，董仲舒“受命”論，不僅指人格神的命令，也指先天的道德的稟賦，還指“氣”的稟受：

先天的道德的稟賦：

氣的稟受：

萬物都是“受命”的，所謂“天者，萬物之祖，……陰陽與天地參然後生。”這裏“天命”都指氣的稟賦。

董仲舒的自然之天的觀點：

這裏所講的天道指的是陰陽有規律的運動、並且週而復始，春夏秋冬不斷輪流更迭。這裏的天道好像更接近科學意義上的解釋，但是董仲舒的儒家思想中包含着深奧無比的神學體系，因此董仲舒牽強附會把他稱爲天意：

天道何以變爲天意？古時候，人們無法真正區分自然知識和宗教之間的區別，他們往往混雜在一起，董仲舒的本意是要消除這種混雜，他的意圖是好的，但是恰恰走反了，他要用神學去消除“自然”，但是秦漢時期自然知識的迅速發展，例如天文學、醫學的發展，使自然知識本身已經具備了強大的影響和力量，是要神學根本無法把它消解。這正是董仲舒的天命思想體系相互混亂和矛盾的重要原因。

接下來，我們看董仲舒的道德之天：

董仲舒的道德之天是指一種道德原則，而且境界很高，是一種“無極之仁”，他不是上帝，也不是物質。正是這種“無極之仁”的存在纔有陰陽五行的運行、自然的更迭和人世社會的變化。所以董仲舒認爲人物關係，人人關係，物物關係歸納起來無外乎君臣關係、父子關係、夫婦關係等倫理的關係。這種倫理關係有受仁、義、禮、智、信支配。這種道德化、神祕化的道德決定論是董仲舒天命思想的本質特徵。