甲減治療缺乏「正能量」，身體不在狀態
甲狀腺激素具有促進生長發育、產熱、促進代謝等作用，是一種具有「正能量」的激素。若缺少「正能量」，體內其它營養物質的代謝都會「慢半拍」。
蛋白質不足
甲減時，胃腸道「效率」變慢，吸收蛋白質的速度也減慢，因此可能造成體內蛋白質不足。若缺少蛋白質，身體將出現消瘦、水腫、免疫力下降，影響心、肝、胃腸等器官的正常運轉，未成年人的發育也因此變得遲緩。
骨質疏鬆
除了蛋白質吸收變慢外，此時鈣質的吸收也減少，易造成骨質疏鬆、病理性骨折等。
維生素A缺乏
皮下胡蘿蔔素也因甲狀腺素的缺乏，轉化爲維生素A的能力減弱。於是維生素A供不應求，由此造成夜盲或暗光中視物不清、眼結膜或角膜乾燥、皮膚乾燥脫屑、影響骨骼生長發育，以及消化道、呼吸道發生感染的機率增加。
體內膽固醇水平增高
甲減時，儘管膽固醇的合成減慢，但其代謝的速度將變得更慢，即膽固醇水平勢必會升高。因此，甲減也成爲血脂升高的「禍首」之一。
貧血
貧血可能由多種因素造成：一方面甲狀腺素的缺乏，骨髓的造血功能受到抑制；另一方面，患者因食慾下降、胃酸分泌減低、某些抗體的產生導致造血原料鐵、葉酸和維生素B12吸收減少。最終導致機體紅細胞不足，引起不同程度的貧血，70%左右的甲減患者會發生貧血。
