瀋陽中衛是明朝遼東都指揮使司的25衛之一。洪武十九年（1386年）八月朱元璋置瀋陽中、左、右3衛。北有撫順千戶所，所東有撫順關。又北有蒲河千戶所。建文期間改瀋陽左衛爲衡山護衛，右衛爲臨安護衛，後復置，2衛又一併調至北京，直屬左軍都督府，只剩下瀋陽中衛與明朝相始終。

洪武二十一年（1388年），在舊城的基礎上修築磚城，周圍9裏30步，牆高2丈5尺，設4門，東門永寧、西門永昌、南門保安、北門安定。

據《全遼志》記載，瀋陽中衛城內和屬下機構有：

察院行臺（衛治西南），瀋陽遊擊府（在衛治西南隅，嘉靖辛丑都御史孫檜奏設），瀋陽備禦公署（在衛治西）；瀋陽中衛治（城東南隅，元總管府舊址），經歷司、鎮撫司、左右中前後所（俱衛治內）；儒學（正統二年都御史李濬奏設，在衛治東），社學；軍器局（衛治西北），軍儲倉（衛治西北），予備倉（衛儲倉內），錢帛庫（衛治西南），養濟院（衛治西南隅），草場（衛治西南隅），教場（城東一里），漏澤園；鹽場百戶所（海州城西南梁房口），鐵場百戶所（安平山城東90裏）；瀋陽在城驛（南關正中），遞運所（城南四里）；撫順城（城東八十里，本古貴德地，洪武十七年創立，周圍3裏有奇，池深1丈，闊2丈，城門1，曰迎恩）；撫順備禦公署（在所治東）；撫順千戶所治，撫順所倉，預備倉，教場；蒲河城（城北40裏，正統二年建，周圍725丈4尺，池深1丈，闊2丈，門2）；蒲陽書院（在所城內，嘉靖十三年巡按御史常時平建）；蒲河備禦公署（在所治西）；蒲河中左千戶所治，軍器局，蒲河所倉，預備倉，教場（城東南1裏）。

瀋陽中衛官吏有：掌印指揮1員、管屯指揮1員、局捕指揮1員、經歷1員、鎮撫1員、儒學教授1員、訓導1員、陰陽正術1員、醫學正科1員、左、右、中、前、後並蒲河中左、撫順7千戶所掌印千戶各1員、管屯千戶各1員、掌印各百戶、鹽場百戶、鐵場百戶、帶管驛，遞百戶、倉大使1員、蒲河、撫順倉副使各1員、庫大使1員。

從1386年開始至1621年被後金攻陷，明朝政府直接統轄了260多年。