儘管蘋果透過M1版MacBook Air及MacBook Pro，展示了自家Apple Silicon的高超技術實力與性能，但包括知名分析師Patrick Moorhead在內，不少用戶皆抱怨有不少慣用的舊程序，無法順利在M1版Mac上正常使用，甚至無法安裝。

這些程序，包括Adobe Reader XI、Acrobat DC、羅技的視訊鏡頭軟件、三星的備份軟件、部分雲端軟件、WinZip 8等。也有一些軟件則需要經Rosetta 2轉譯，如微軟的Edge瀏覽器，以及Office相關應用，並可能在一開始有一些速率較慢的問題。

一些技術軟件如Docker，目前也無法順利使用，或是因沒有最佳化，需要更長的時間才能完成運作。

Patrick Moorhead甚至指出其M1版MacBook Pro或許因系統剛重整完成，大約5個多小時就只剩下10%電量，並未展示出蘋果承諾的續航時間。

整體來說，因M1處理器爲平臺構架級的大移轉，儘管蘋果原生App大多已有一定程度的最佳化，但用戶仍需注意常用的第三方軟件，如輸入法等，是否能正常支持M1版Mac，避免入手後日常使用有麻煩。