這份十七世紀的《賢者之石》文件手稿是由艾薩克·牛頓本人親自抄寫，原由私人收藏，後來被美國化學遺產基金會買下後進行了公開。這上面記載着神祕的《賢者之石》創造過程的基本原則部份，是鍊金術士們相信可以將不同的金屬轉變成黃金的主要配方。

《賢者之石》鍊金術配方手稿包含了另一個鍊金術士本人手稿，也有牛頓自己的實驗說明。美國化學遺產基金會將這古老的手稿內容公開給大衆利用進行研究，館長詹姆斯·弗爾克爾解說：“這個被稱作‘賢者水銀’的物質可以被用來將金屬分解成他們原來的構造。這個概念就是若你將金屬分解掉，然後就可以重組他們變成不同的金屬，這個過程是製作‘賢者之石’最費功夫的地方，鍊金術士們相信加入某個神祕的物質配方就可以把鉛轉換成黃金。”

手稿的抬頭用拉丁文轉譯過來是：“藉由火星和月球上的銻塊，可以製作出‘賢者之石’所需要的重要配方‘賢者水銀’。”研究者認爲這份手稿是用來敘述製作‘賢者水銀’的必要過程，儘管並不確定牛頓本人是否曾嘗試製作出這個物質，但他們知道天才的本事和他對深奧事物的狂熱，所以他們傾向肯定的答案。

牛頓是過去最重要的科學家之一，他是以萬有引力定律著名的，並且對全球物理學有重大的影向力，他也是一位狂熱的鍊金術士。事實上這份手稿也是被討論到的重點之一，因爲這是牛頓所有的科學實驗中一個隱藏版的知識領域。這份手稿的正本作者應該是著名鍊金術士費拉勒德斯（筆名）所著，牛頓翻譯抄寫的手稿副本，有可能在印刷本出版前就存在了，因爲牛頓在抄寫翻譯過程中也出現了錯誤，作者寫拉丁文的(ex)是指‘在…範圍之外’，而不是‘以及’的意思，牛頓錯看這個部份，然後在方塊括號中加註了修正。後來的印刷版本，早就已經是修正的了。

弗爾克爾說：“牛頓只是在手稿背面加上了自己的描述，他本人是否進行過‘賢者之石’實驗並不確定。不過其中有一個配方是他進行過的實驗筆記，在鍊金術製程中，將鉛礦蒸餾出揮發性物質。目前翻譯修正是個巨大的工程，估計牛頓手中的鍊金術相關著作至少有百萬個字，這對他數以百計的書籍來說只是其中一小頁而已。”