南京醫科大學是首批教育部、國家衛生健康委與省政府共建醫學院校和江蘇高水平大學建設高校。學校創建於1934年，時名江蘇省立醫政學院。1957年，由鎮江遷至南京，更名爲南京醫學院。1962年，被列爲全國首批六年制醫藥院校。1981年，被批准爲全國首批博士、碩士學位授予單位。1993年，更名爲南京醫科大學。

學校設有26個本科專業，1個九年本碩博一貫制專業方向、3個“5+3”本碩一體化專業方向。目前，學生總數爲1.9萬多人，已形成從本科生、研究生到博士後，從全日制到成人教育、留學生教育全方位、多層次的教育體系。

學校建有江寧校區、五臺校區以及康達學院連雲港校區。江寧校區位於南京市江寧區大學城，佔地面積1300畝，是行政、教學和科研中心。五臺校區位於南京市鼓樓區五臺山南麓，佔地120畝，是臨牀教學和研究中心。學校館藏圖書文獻資料豐富，擁有中文（外文）紙質圖書、電子圖書、全文電子期刊共一千多萬冊，是江蘇省醫學圖書中心館和高校文獻保障系統醫學文獻中心。學校主辦有11種學術期刊。

學校設有19個學院（包含康達學院）。擁有28所附屬醫院和1所附屬疾控中心。學校校本部現有在職教職工1800多人，其中學校編制專任教師952人。有教授302人、副教授255人，有博士生導師720人、碩士生導師2317人。學校現有中國工程院院士2名，美國國家醫學院外籍院士1名，“長江學者獎勵計劃”特聘教授3名、青年學者2名，國家百千萬人才工程7人，國家傑出青年科學基金獲得者10人。

學校現有一級學科博士學位授權點8個（生物學、基礎醫學、臨牀醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、藥學、醫學技術、護理學）、二級學科博士學位授權點54個、3個交叉學科博士學位授權點（臨牀醫學工程、人文醫學、健康政策管理）；一級學科碩士學位授權點11個、二級學科碩士學位授權點65個；博士後科研流動站7個，學位授權點已覆蓋醫學、理學、工學、管理學、法學、教育學和文學等7個學科門類；擁有3個國家重點學科、1個國家重點培育學科、29個國家臨牀重點專科、6個江蘇高校優勢學科（三期）、2個江蘇省一級學科重點學科、3個江蘇省一級學科重點培育學科。

在全國第四輪學科評估中，我校公共衛生與預防醫學在全國54所參評高校中獲評A+等級。臨牀醫學、分子生物學與遺傳學、生物學與生物化學、神經科學與行爲學、藥理學和毒理學、免疫學、社會科學總論、化學等8個學科進入ESI全球排名前1%，其中，臨牀醫學學科進入ESI全球排名前1‰。

學校現有1個國家重點實驗室、1個國家級國際聯合研究中心、28個部省級重點實驗室（工程中心、智庫）、2個省級協同創新中心。擁有國內一流的醫學模擬教育中心（MSC）和自主學習中心以及國內知名、省內一流的江蘇省醫藥動物實驗基地，建有江蘇省唯一的省級衛生政策智庫健康江蘇研究院以及省內唯一的轉化醫學研究機構江蘇省轉化醫學研究院。

進入“十三五”，全校師生醫護員工凝心聚力、統籌施策、開拓創新、改革攻堅，全面啓動實施“十三五”發展規劃，努力把學校建成國際知名、特色鮮明的高水平研究型醫科大學。